More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4676 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6737  chemotaxis protein cheA  69.03 
 
 		 681 aa  924    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0145  CheA signal transduction histidine kinase  70.87 
 
 		 688 aa  938    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  52.49 
 
 		 679 aa  680    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1399  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  57.23 
 
 		 693 aa  696    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  53.63 
 
 		 652 aa  676    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4676  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 		 686 aa  1367    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  52.44 
 
 		 679 aa  676    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4316  Chemotaxis protein histidine kinase  51.02 
 
 		 685 aa  647    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7839  CheA signal transduction histidine kinase  69.01 
 
 		 691 aa  934    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  48.45 
 
 		 654 aa  568  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  44.96 
 
 		 712 aa  553  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1584  chemotaxis histidine protein kinase  48.89 
 
 		 654 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.678464  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0236  CheA signal transduction histidine kinases  48.74 
 
 		 654 aa  542  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5775  CheA signal transduction histidine kinase  73.37 
 
 		 714 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4815  CheA signal transduction histidine kinase  74.27 
 
 		 702 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391755 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  44.49 
 
 		 707 aa  539  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  44.89 
 
 		 698 aa  538  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  44.46 
 
 		 686 aa  534  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  43.75 
 
 		 701 aa  531  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1379  CheA signal transduction histidine kinase  47.73 
 
 		 658 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0851844  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  44.89 
 
 		 696 aa  532  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  42.96 
 
 		 709 aa  526  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  43.95 
 
 		 682 aa  520  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2574  CheA signal transduction histidine kinase  47.38 
 
 		 661 aa  522  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.12503  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  43.55 
 
 		 694 aa  514  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  41.94 
 
 		 708 aa  514  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 		 702 aa  512  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  43.45 
 
 		 724 aa  510  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 		 709 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  41.58 
 
 		 702 aa  501  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  38.43 
 
 		 720 aa  488  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2940  CheA signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 		 708 aa  480  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 		 697 aa  476  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  38.77 
 
 		 700 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  38.62 
 
 		 705 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  37.17 
 
 		 741 aa  456  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 		 732 aa  457  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  35.45 
 
 		 733 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1533  CheA signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 750 aa  431  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037058 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1317  CheA signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 		 733 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.460815  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 686 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0578  chemotaxis histidine kinase  34 
 
 		 714 aa  418  9.999999999999999e-116  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 695 aa  409  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 688 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 677 aa  405  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 682 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  34.49 
 
 		 720 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0619  CheA signal transduction histidine kinase  36.38 
 
 		 794 aa  398  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0110186 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 		 694 aa  397  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1209  CheA signal transduction histidine kinases  37.3 
 
 		 697 aa  396  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  36.55 
 
 		 703 aa  397  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1568  CheA signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 739 aa  386  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 699 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2478  CheA signal transduction histidine kinase  56.25 
 
 		 660 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54146  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0332  CheA signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 756 aa  383  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 707 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 684 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  35.7 
 
 		 681 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 684 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  36.97 
 
 		 684 aa  375  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  39.11 
 
 		 806 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  36.1 
 
 		 669 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1852  CheA signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 664 aa  365  1e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.758409  normal  0.445859 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00032  chemotaxis protein CheA  35.38 
 
 		 669 aa  366  1e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.814284  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 702 aa  362  1e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 691 aa  361  3e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  35.42 
 
 		 674 aa  360  6e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  36.19 
 
 		 662 aa  359  9.999999999999999e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  36.08 
 
 		 655 aa  357  3.9999999999999996e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 713 aa  356  7.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2708  CheA signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 735 aa  355  2e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972076  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 673 aa  355  2e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  34.28 
 
 		 715 aa  355  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1989  ATP-binding region ATPase domain protein  32.56 
 
 		 678 aa  354  2.9999999999999997e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  35.01 
 
 		 652 aa  353  7e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  35.15 
 
 		 654 aa  352  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3689  CheA signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 		 671 aa  352  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.296916  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  35.44 
 
 		 654 aa  351  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 696 aa  352  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 654 aa  351  3e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  35.29 
 
 		 654 aa  351  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  35.29 
 
 		 652 aa  350  3e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  34.86 
 
 		 654 aa  350  4e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  35.47 
 
 		 654 aa  350  7e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  35.47 
 
 		 654 aa  350  7e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  34.76 
 
 		 669 aa  349  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 724 aa  349  1e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  34.76 
 
 		 669 aa  349  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  34.76 
 
 		 669 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 697 aa  348  2e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 675 aa  348  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  34.9 
 
 		 669 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 724 aa  348  3e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  34.61 
 
 		 669 aa  347  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 747 aa  345  1e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1540  chemotaxis protein CheA  35.26 
 
 		 672 aa  345  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0565086  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 759 aa  344  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 666 aa  343  5e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  30.76 
 
 		 660 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 681 aa  343  8e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>