More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2708 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  57.39 
 
 
759 aa  774    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4077  Chemotaxis protein histidine kinase  57.53 
 
 
662 aa  668    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0298  CheA signal transduction histidine kinase  56.43 
 
 
763 aa  781    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265941  normal  0.326442 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0330  CheA signal transduction histidine kinase  56.8 
 
 
758 aa  775    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.362553  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0279  CheA signal transduction histidine kinase  56.09 
 
 
751 aa  748    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597552  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  63.47 
 
 
747 aa  846    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2708  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
735 aa  1442    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972076  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1794  CheA signal transduction histidine kinase  49.58 
 
 
686 aa  621  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3467  CheA signal transduction histidine kinase  46.77 
 
 
751 aa  605  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.124475 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2436  chemotaxis histidine protein kinase, CheA1  49.86 
 
 
686 aa  599  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.916157  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1100  CheA signal transduction histidine kinases  49.86 
 
 
686 aa  598  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.748454  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2841  CheA signal transduction histidine kinases  46.99 
 
 
748 aa  588  1e-166  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.922689  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1446  CheA signal transduction histidine kinase  76.41 
 
 
760 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3206  CheA signal transduction histidine kinases  46.44 
 
 
711 aa  579  1e-164  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136095  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 
694 aa  501  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  39.86 
 
 
720 aa  497  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 
682 aa  482  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 
677 aa  482  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 
707 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 
686 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 
688 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  39.97 
 
 
669 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  40.54 
 
 
674 aa  463  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  39.89 
 
 
662 aa  465  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 
684 aa  465  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1852  CheA signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 
664 aa  465  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.758409  normal  0.445859 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  40.17 
 
 
703 aa  466  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  38.54 
 
 
715 aa  457  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  38.42 
 
 
681 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
695 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  39.75 
 
 
669 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 
684 aa  450  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  39.75 
 
 
669 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  39.61 
 
 
669 aa  449  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  39.47 
 
 
669 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  39.33 
 
 
669 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 
654 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  38.97 
 
 
654 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  39.11 
 
 
654 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  38.97 
 
 
654 aa  439  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  38.77 
 
 
652 aa  437  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  38.77 
 
 
652 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  38.97 
 
 
654 aa  439  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5608  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  38.89 
 
 
673 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3689  CheA signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 
671 aa  438  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.296916  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  38.97 
 
 
654 aa  437  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  38.05 
 
 
655 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  39.25 
 
 
654 aa  439  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  37.89 
 
 
717 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  37.25 
 
 
727 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  37.08 
 
 
717 aa  427  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  57.82 
 
 
684 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  41.71 
 
 
806 aa  424  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  35.83 
 
 
702 aa  412  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 
686 aa  409  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  35.61 
 
 
741 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  36.52 
 
 
758 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
709 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 
694 aa  397  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  36.85 
 
 
682 aa  399  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
698 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6737  chemotaxis protein cheA  36.96 
 
 
681 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4676  CheA signal transduction histidine kinases  36.59 
 
 
686 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  35.29 
 
 
705 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
709 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 
699 aa  391  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  36.05 
 
 
708 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  35.81 
 
 
700 aa  389  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 
696 aa  388  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 
679 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4156  CheA signal transduction histidine kinase  48.88 
 
 
684 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.847585  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  37.48 
 
 
701 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3299  CheA signal transduction histidine kinase  43.63 
 
 
671 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
652 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 
712 aa  385  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 
724 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  50 
 
 
784 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
702 aa  382  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  47.31 
 
 
724 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  35.85 
 
 
707 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 
679 aa  379  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 
732 aa  379  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  35.97 
 
 
720 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0119  CheA Signal transduction histidine Kinases(STHK)  48.71 
 
 
766 aa  379  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7839  CheA signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 
691 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  44.03 
 
 
704 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  47.27 
 
 
724 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2859  chemotaxis protein CheA  49.23 
 
 
767 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1684  chemotaxis protein CheA  49.23 
 
 
767 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.41407  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  32.66 
 
 
733 aa  373  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2093  CheA signal transduction histidine kinases  49.61 
 
 
736 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.768244 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3116  chemotaxis protein CheA  49.23 
 
 
767 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1881  CheA signal transduction histidine kinases  49.61 
 
 
736 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.254979 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3815  CheA signal transduction histidine kinase  48.45 
 
 
766 aa  375  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
654 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3435  chemotaxis protein CheA  49.23 
 
 
767 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0238  CheA signal transduction histidine kinase  48.08 
 
 
750 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119172  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0165  CheA signal transduction histidine kinase  48.2 
 
 
761 aa  372  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.690811 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0077  chemotaxis protein CheA  49.35 
 
 
765 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3358  CheA signal transduction histidine kinase  47.58 
 
 
749 aa  372  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.701672  normal  0.794513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>