More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1852 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00032  chemotaxis protein CheA  82.14 
 
 
669 aa  1051    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.814284  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1852  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
664 aa  1311    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.758409  normal  0.445859 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  46.68 
 
 
686 aa  592  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  45.66 
 
 
720 aa  591  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  49.48 
 
 
684 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  49.63 
 
 
682 aa  580  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  47.63 
 
 
677 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  45.12 
 
 
688 aa  570  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  44.9 
 
 
694 aa  572  1e-161  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  47.6 
 
 
684 aa  569  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  46.21 
 
 
707 aa  565  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  47.61 
 
 
669 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  47.61 
 
 
669 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  46.18 
 
 
703 aa  555  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  47.61 
 
 
669 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  47.61 
 
 
669 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  47.46 
 
 
669 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0585  chemotaxis protein histidine kinase  47.12 
 
 
719 aa  548  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.648466  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  47.23 
 
 
654 aa  545  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  46.91 
 
 
654 aa  546  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  47.23 
 
 
654 aa  545  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  46.91 
 
 
654 aa  546  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  46.64 
 
 
654 aa  548  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  46.76 
 
 
654 aa  546  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  45.94 
 
 
695 aa  548  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  47.35 
 
 
662 aa  542  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  47.36 
 
 
669 aa  542  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  43.99 
 
 
715 aa  543  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  46.35 
 
 
654 aa  544  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  46.76 
 
 
652 aa  542  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  46.33 
 
 
652 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  47.31 
 
 
674 aa  541  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  46.95 
 
 
681 aa  537  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3689  CheA signal transduction histidine kinase  46.43 
 
 
671 aa  537  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.296916  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  47.21 
 
 
655 aa  538  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  48.11 
 
 
625 aa  525  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1540  chemotaxis protein CheA  46.12 
 
 
672 aa  523  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0565086  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  43.97 
 
 
717 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 
724 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02250  putative two-component sensor  47.38 
 
 
639 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.108586  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  44.41 
 
 
704 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  42.6 
 
 
728 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  44.27 
 
 
684 aa  514  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  43.69 
 
 
717 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4160  CheA signal transduction histidine kinase  65.28 
 
 
724 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158924  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  43.08 
 
 
727 aa  505  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4048  CheA signal transduction histidine kinase  65.28 
 
 
724 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507068  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  51.53 
 
 
806 aa  499  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2093  CheA signal transduction histidine kinases  42.16 
 
 
736 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.768244 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1881  CheA signal transduction histidine kinases  41.86 
 
 
736 aa  500  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.254979 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  42.51 
 
 
702 aa  498  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1408  chemotaxis sensor histidine kinase transcription regulator protein  64.06 
 
 
726 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.146245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  60.19 
 
 
732 aa  489  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  57.67 
 
 
784 aa  483  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 
747 aa  482  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2974  CheA signal transduction histidine kinase  60.93 
 
 
772 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131554 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1624  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  60.87 
 
 
691 aa  480  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.885628  normal  0.805041 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0165  CheA signal transduction histidine kinase  60.93 
 
 
761 aa  481  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.690811 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3815  CheA signal transduction histidine kinase  60.41 
 
 
766 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3358  CheA signal transduction histidine kinase  60.98 
 
 
749 aa  477  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.701672  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0182  CheA signal transduction histidine kinase  60.93 
 
 
743 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0119  CheA Signal transduction histidine Kinases(STHK)  60.41 
 
 
766 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2851  CheA signal transduction histidine kinases  60.41 
 
 
756 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0238  CheA signal transduction histidine kinase  60.41 
 
 
750 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119172  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0169  CheA signal transduction histidine kinases  60.93 
 
 
744 aa  479  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454346  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0256  CheA signal transduction histidine kinases  60.41 
 
 
756 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1599  CheA signal transduction histidine kinase  60.34 
 
 
722 aa  475  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  56.48 
 
 
783 aa  475  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00412  probable two-component sensor (CheA)  40.71 
 
 
674 aa  475  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4378  CheA signal transduction histidine kinase  57.38 
 
 
725 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0279  CheA signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 
751 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597552  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  57.14 
 
 
729 aa  464  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 
759 aa  464  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0298  CheA signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 
763 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265941  normal  0.326442 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2708  CheA signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 
735 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972076  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2176  CheA signal transduction histidine kinases  58.91 
 
 
709 aa  461  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749003  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4156  CheA signal transduction histidine kinase  58.85 
 
 
684 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.847585  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0156  chemotaxis protein CheA  60.84 
 
 
747 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.93752  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3790  CheA signal transduction histidine kinases  60.05 
 
 
710 aa  456  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  57.52 
 
 
758 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
702 aa  451  1e-125  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24340  Chemotaxis sensory histidine protein kinase; CheA  60 
 
 
697 aa  451  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1794  CheA signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 
686 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  39.21 
 
 
724 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2436  chemotaxis histidine protein kinase, CheA1  40.06 
 
 
686 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.916157  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 
699 aa  438  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1100  CheA signal transduction histidine kinases  39.91 
 
 
686 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.748454  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 
709 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  38.37 
 
 
708 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  37.52 
 
 
709 aa  427  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2841  CheA signal transduction histidine kinases  36.58 
 
 
748 aa  427  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.922689  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
712 aa  423  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3467  CheA signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 
751 aa  424  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.124475 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  52.94 
 
 
724 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3206  CheA signal transduction histidine kinases  35.62 
 
 
711 aa  424  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136095  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  37.76 
 
 
707 aa  425  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 
702 aa  420  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  39.73 
 
 
652 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 
679 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  40.06 
 
 
700 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>