More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4077 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0298  CheA signal transduction histidine kinase  78.37 
 
 		 763 aa  976    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265941  normal  0.326442 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  75 
 
 		 759 aa  966    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4077  Chemotaxis protein histidine kinase  100 
 
 		 662 aa  1323    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0330  CheA signal transduction histidine kinase  79.25 
 
 		 758 aa  996    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.362553  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  58.8 
 
 		 747 aa  704    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0279  CheA signal transduction histidine kinase  53.58 
 
 		 751 aa  632  1e-180  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597552  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2708  CheA signal transduction histidine kinase  56.41 
 
 		 735 aa  628  1e-179  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972076  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1446  CheA signal transduction histidine kinase  74.62 
 
 		 760 aa  580  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3206  CheA signal transduction histidine kinases  43.27 
 
 		 711 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1794  CheA signal transduction histidine kinase  44.98 
 
 		 686 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2436  chemotaxis histidine protein kinase, CheA1  48.77 
 
 		 686 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.916157  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1100  CheA signal transduction histidine kinases  48.77 
 
 		 686 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.748454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2841  CheA signal transduction histidine kinases  45.45 
 
 		 748 aa  509  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.922689  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3467  CheA signal transduction histidine kinase  45.22 
 
 		 751 aa  505  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.124475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  47.56 
 
 		 684 aa  490  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 707 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 		 694 aa  419  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 		 682 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 		 677 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5608  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  49.15 
 
 		 673 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  46.82 
 
 		 674 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  40.97 
 
 		 806 aa  396  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 688 aa  399  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 686 aa  393  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  46.21 
 
 		 669 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  47 
 
 		 654 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  47.25 
 
 		 654 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  46.21 
 
 		 669 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  46.21 
 
 		 669 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  41.13 
 
 		 717 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  48.28 
 
 		 724 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  47 
 
 		 654 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  47 
 
 		 652 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  46.21 
 
 		 669 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  47 
 
 		 654 aa  389  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  47 
 
 		 654 aa  389  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  46.08 
 
 		 669 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  45.97 
 
 		 669 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  47 
 
 		 654 aa  389  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  45.52 
 
 		 681 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  47 
 
 		 654 aa  389  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  47 
 
 		 652 aa  389  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  38.75 
 
 		 703 aa  387  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  49.74 
 
 		 728 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  40.36 
 
 		 727 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 		 684 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  40.66 
 
 		 717 aa  385  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  47.94 
 
 		 715 aa  385  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  45.59 
 
 		 662 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3116  chemotaxis protein CheA  47.96 
 
 		 767 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  49.48 
 
 		 724 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2859  chemotaxis protein CheA  47.96 
 
 		 767 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4156  CheA signal transduction histidine kinase  47.55 
 
 		 684 aa  381  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.847585  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1684  chemotaxis protein CheA  47.96 
 
 		 767 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.41407  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 		 695 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3435  chemotaxis protein CheA  47.96 
 
 		 767 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3689  CheA signal transduction histidine kinase  48.36 
 
 		 671 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.296916  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2093  CheA signal transduction histidine kinases  48.69 
 
 		 736 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.768244 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1881  CheA signal transduction histidine kinases  48.69 
 
 		 736 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.254979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  47.32 
 
 		 704 aa  379  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  47.53 
 
 		 784 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0238  CheA signal transduction histidine kinase  47.29 
 
 		 750 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0119  CheA Signal transduction histidine Kinases(STHK)  46.23 
 
 		 766 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 684 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  45.43 
 
 		 655 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  35.15 
 
 		 720 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0182  CheA signal transduction histidine kinase  47.29 
 
 		 743 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0169  CheA signal transduction histidine kinases  47.29 
 
 		 744 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454346  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3815  CheA signal transduction histidine kinase  46.75 
 
 		 766 aa  375  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1540  chemotaxis protein CheA  46.77 
 
 		 672 aa  375  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0565086  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  46.12 
 
 		 702 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0077  chemotaxis protein CheA  47.66 
 
 		 765 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3358  CheA signal transduction histidine kinase  47.4 
 
 		 749 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.701672  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3182  chemotaxis protein CheA  47.14 
 
 		 749 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.671944  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3936  chemotaxis protein CheA  47.66 
 
 		 765 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3855  chemotaxis protein CheA  47.66 
 
 		 762 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0165  CheA signal transduction histidine kinase  47.29 
 
 		 761 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.690811 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4048  CheA signal transduction histidine kinase  46.33 
 
 		 724 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  49.34 
 
 		 625 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00032  chemotaxis protein CheA  47.77 
 
 		 669 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.814284  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 699 aa  368  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1852  CheA signal transduction histidine kinase  39.03 
 
 		 664 aa  368  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.758409  normal  0.445859 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4160  CheA signal transduction histidine kinase  46.33 
 
 		 724 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 		 696 aa  365  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02250  putative two-component sensor  49.34 
 
 		 639 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.108586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  46.91 
 
 		 732 aa  363  4e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1624  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  46 
 
 		 691 aa  363  6e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.885628  normal  0.805041 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 698 aa  362  9e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  45.32 
 
 		 783 aa  361  2e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3299  CheA signal transduction histidine kinase  46.68 
 
 		 671 aa  362  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1408  chemotaxis sensor histidine kinase transcription regulator protein  46.23 
 
 		 726 aa  359  7e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.146245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 679 aa  359  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1599  CheA signal transduction histidine kinase  44.66 
 
 		 722 aa  357  2.9999999999999997e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 682 aa  358  2.9999999999999997e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  35.23 
 
 		 708 aa  357  5e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24340  Chemotaxis sensory histidine protein kinase; CheA  44.84 
 
 		 697 aa  357  5.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00412  probable two-component sensor (CheA)  46.97 
 
 		 674 aa  355  1e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3064  CheA signal transduction histidine kinase  46.55 
 
 		 710 aa  355  2e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 686 aa  353  4e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  36.35 
 
 		 758 aa  353  5e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>