More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0619 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0619  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
794 aa  1532    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0110186 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1209  CheA signal transduction histidine kinases  65.16 
 
 
697 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 
694 aa  476  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  39.62 
 
 
708 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 
709 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
682 aa  433  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  37 
 
 
712 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 
702 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  35.56 
 
 
707 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  36.33 
 
 
701 aa  422  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  41.51 
 
 
724 aa  388  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1399  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.6 
 
 
693 aa  378  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 
696 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 
698 aa  379  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2940  CheA signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
708 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 
697 aa  372  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 
686 aa  371  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  33.42 
 
 
741 aa  355  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0578  chemotaxis histidine kinase  29.33 
 
 
714 aa  352  2e-95  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  47.88 
 
 
702 aa  349  1e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  46.88 
 
 
709 aa  348  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  32.33 
 
 
733 aa  348  2e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  31.58 
 
 
720 aa  342  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  32.03 
 
 
720 aa  342  2e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4676  CheA signal transduction histidine kinases  36.87 
 
 
686 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  30.23 
 
 
806 aa  335  1e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6737  chemotaxis protein cheA  47.3 
 
 
681 aa  333  8e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1568  CheA signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 
739 aa  333  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0145  CheA signal transduction histidine kinase  45.2 
 
 
688 aa  330  8e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7839  CheA signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 
691 aa  330  8e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 
688 aa  330  9e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  44.98 
 
 
652 aa  325  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 
677 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
732 aa  321  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
759 aa  317  6e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 
679 aa  312  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4316  Chemotaxis protein histidine kinase  44.88 
 
 
685 aa  311  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  44.31 
 
 
679 aa  310  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1379  CheA signal transduction histidine kinase  48.91 
 
 
658 aa  309  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0851844  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2478  CheA signal transduction histidine kinase  48.91 
 
 
660 aa  308  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2574  CheA signal transduction histidine kinase  48.91 
 
 
661 aa  306  7e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.12503  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1317  CheA signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
733 aa  306  8.000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.460815  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  42.82 
 
 
654 aa  306  9.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4815  CheA signal transduction histidine kinase  48 
 
 
702 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391755 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1584  chemotaxis histidine protein kinase  44.16 
 
 
654 aa  302  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.678464  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0236  CheA signal transduction histidine kinases  43.91 
 
 
654 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
707 aa  301  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24340  Chemotaxis sensory histidine protein kinase; CheA  44.47 
 
 
697 aa  299  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
686 aa  296  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0433  CheA signal transduction histidine kinase  42.45 
 
 
730 aa  295  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.645464  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  40 
 
 
694 aa  293  6e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  42.49 
 
 
783 aa  293  6e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0585  chemotaxis protein histidine kinase  42.14 
 
 
719 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.648466  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4048  CheA signal transduction histidine kinase  44.68 
 
 
724 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507068  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4160  CheA signal transduction histidine kinase  44.68 
 
 
724 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158924  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  39.06 
 
 
715 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1599  CheA signal transduction histidine kinase  42.12 
 
 
722 aa  283  7.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1624  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  40.25 
 
 
691 aa  283  9e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.885628  normal  0.805041 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1408  chemotaxis sensor histidine kinase transcription regulator protein  44.13 
 
 
726 aa  283  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.146245 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3815  CheA signal transduction histidine kinase  41.71 
 
 
766 aa  283  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3790  CheA signal transduction histidine kinases  42.27 
 
 
710 aa  283  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3064  CheA signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 
710 aa  281  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  43.22 
 
 
625 aa  282  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  32.24 
 
 
700 aa  281  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0165  CheA signal transduction histidine kinase  42.56 
 
 
761 aa  281  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.690811 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 
660 aa  280  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02250  putative two-component sensor  42.61 
 
 
639 aa  280  6e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.108586  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  36.56 
 
 
754 aa  280  7e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
724 aa  280  7e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3206  CheA signal transduction histidine kinases  31.66 
 
 
711 aa  280  9e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136095  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
724 aa  280  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  40 
 
 
732 aa  279  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2974  CheA signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 
772 aa  279  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131554 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  37.56 
 
 
767 aa  279  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0119  CheA Signal transduction histidine Kinases(STHK)  41.45 
 
 
766 aa  279  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
770 aa  280  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
728 aa  279  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0332  CheA signal transduction histidine kinase  35.3 
 
 
756 aa  278  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  40.36 
 
 
705 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1852  CheA signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 
664 aa  278  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.758409  normal  0.445859 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 
675 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  39.06 
 
 
714 aa  278  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4156  CheA signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
684 aa  278  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.847585  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  31.25 
 
 
729 aa  278  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 
666 aa  278  4e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
695 aa  277  5e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0182  CheA signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 
743 aa  276  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 
747 aa  276  8e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0169  CheA signal transduction histidine kinases  41.65 
 
 
744 aa  276  9e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454346  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3358  CheA signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 
749 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.701672  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0238  CheA signal transduction histidine kinase  42.3 
 
 
750 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119172  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2851  CheA signal transduction histidine kinases  42.3 
 
 
756 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0256  CheA signal transduction histidine kinases  42.3 
 
 
756 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 
741 aa  275  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2176  CheA signal transduction histidine kinases  42.56 
 
 
709 aa  275  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749003  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 
713 aa  274  4.0000000000000004e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
673 aa  274  5.000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1881  CheA signal transduction histidine kinases  38.74 
 
 
736 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.254979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  37.81 
 
 
704 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00032  chemotaxis protein CheA  42.22 
 
 
669 aa  274  5.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.814284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>