More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1568 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1568  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 739 aa  1489    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  49.38 
 
 		 741 aa  668    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  49.22 
 
 		 720 aa  645    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  49.86 
 
 		 732 aa  639    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  45.56 
 
 		 733 aa  627  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1317  CheA signal transduction histidine kinase  49.86 
 
 		 733 aa  615  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.460815  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  48.16 
 
 		 700 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  47.99 
 
 		 705 aa  585  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1533  CheA signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 		 750 aa  576  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037058 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0332  CheA signal transduction histidine kinase  43.06 
 
 		 756 aa  510  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  39.3 
 
 		 707 aa  474  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 		 702 aa  462  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 702 aa  459  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  39.77 
 
 		 701 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  39.03 
 
 		 709 aa  452  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 712 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  38.23 
 
 		 708 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 682 aa  445  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 686 aa  444  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 709 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 699 aa  429  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 696 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 698 aa  428  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 		 724 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2940  CheA signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 708 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 		 697 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  35.98 
 
 		 806 aa  416  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 695 aa  415  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 677 aa  412  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 688 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 686 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 		 694 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1399  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.99 
 
 		 693 aa  404  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0145  CheA signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 688 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6737  chemotaxis protein cheA  36.39 
 
 		 681 aa  399  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7839  CheA signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 691 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  35.52 
 
 		 720 aa  393  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 652 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 694 aa  391  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4676  CheA signal transduction histidine kinases  35.26 
 
 		 686 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 702 aa  389  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 		 654 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4316  Chemotaxis protein histidine kinase  34.92 
 
 		 685 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0279  CheA signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 751 aa  362  1e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597552  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 747 aa  360  4e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 759 aa  360  7e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0330  CheA signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 758 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.362553  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3467  CheA signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 751 aa  358  1.9999999999999998e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.124475 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 707 aa  356  6.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 679 aa  356  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 724 aa  356  8.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 713 aa  356  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 724 aa  352  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  35.59 
 
 		 704 aa  351  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 675 aa  350  6e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  33.24 
 
 		 703 aa  349  1e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 729 aa  349  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 697 aa  348  3e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 679 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2841  CheA signal transduction histidine kinases  33.9 
 
 		 748 aa  344  2.9999999999999997e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.922689  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 666 aa  342  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  33.88 
 
 		 702 aa  342  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  33.61 
 
 		 662 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 681 aa  341  2.9999999999999998e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1989  ATP-binding region ATPase domain protein  32.3 
 
 		 678 aa  341  2.9999999999999998e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3317  CheA signal transduction histidine kinase  46.17 
 
 		 536 aa  340  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 691 aa  340  8e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 682 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3206  CheA signal transduction histidine kinases  32.47 
 
 		 711 aa  337  5.999999999999999e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 660 aa  336  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0578  chemotaxis histidine kinase  31.41 
 
 		 714 aa  336  1e-90  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  34.26 
 
 		 717 aa  332  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  33.66 
 
 		 669 aa  331  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0974  CheA signal transduction histidine kinases  31.66 
 
 		 691 aa  331  3e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 696 aa  331  3e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0603  CheA signal transduction histidine kinase  46.6 
 
 		 551 aa  331  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  32.78 
 
 		 684 aa  331  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0637  CheA signal transduction histidine kinase  46.07 
 
 		 551 aa  330  8e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0628  CheA signal transduction histidine kinase  46.07 
 
 		 553 aa  330  8e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 684 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0619  CheA signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 794 aa  327  3e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0110186 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4077  Chemotaxis protein histidine kinase  37.28 
 
 		 662 aa  328  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  34.21 
 
 		 717 aa  327  5e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  33.6 
 
 		 758 aa  325  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  31.21 
 
 		 927 aa  323  9.000000000000001e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  32.69 
 
 		 685 aa  321  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1794  CheA signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 686 aa  319  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 741 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0647  CheA signal transduction histidine kinase  47.21 
 
 		 558 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4378  CheA signal transduction histidine kinase  43.13 
 
 		 725 aa  313  5.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1881  CheA signal transduction histidine kinases  45.69 
 
 		 736 aa  313  9e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.254979 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2093  CheA signal transduction histidine kinases  45.69 
 
 		 736 aa  312  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.768244 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  44.84 
 
 		 674 aa  312  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  45.23 
 
 		 732 aa  310  6.999999999999999e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  45.95 
 
 		 728 aa  310  8e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 		 654 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  45.69 
 
 		 681 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0236  CheA signal transduction histidine kinases  43.01 
 
 		 654 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1584  chemotaxis histidine protein kinase  42.74 
 
 		 654 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.678464  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  44.39 
 
 		 654 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>