More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1399 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  56.73 
 
 		 679 aa  731    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6737  chemotaxis protein cheA  57.48 
 
 		 681 aa  736    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4316  Chemotaxis protein histidine kinase  55.43 
 
 		 685 aa  725    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  57.1 
 
 		 679 aa  738    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1399  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  100 
 
 		 693 aa  1372    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0145  CheA signal transduction histidine kinase  56.14 
 
 		 688 aa  728    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4676  CheA signal transduction histidine kinases  56.65 
 
 		 686 aa  727    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  49.56 
 
 		 707 aa  647    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  60.17 
 
 		 652 aa  774    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7839  CheA signal transduction histidine kinase  56.9 
 
 		 691 aa  709    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  50.58 
 
 		 698 aa  634  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  50.8 
 
 		 696 aa  632  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  49.35 
 
 		 712 aa  630  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  49.54 
 
 		 682 aa  625  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  49.93 
 
 		 709 aa  627  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  51.67 
 
 		 702 aa  628  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  50.66 
 
 		 701 aa  625  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  49.92 
 
 		 686 aa  623  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  48.86 
 
 		 709 aa  616  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  49.65 
 
 		 724 aa  611  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  47.73 
 
 		 702 aa  607  9.999999999999999e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  49.35 
 
 		 708 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2940  CheA signal transduction histidine kinase  49.05 
 
 		 708 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  49.13 
 
 		 697 aa  598  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  47.15 
 
 		 654 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  44.15 
 
 		 694 aa  548  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  40.28 
 
 		 720 aa  514  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 		 732 aa  499  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4815  CheA signal transduction histidine kinase  69.82 
 
 		 702 aa  498  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391755 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5775  CheA signal transduction histidine kinase  69.82 
 
 		 714 aa  498  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  41.41 
 
 		 700 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  40.46 
 
 		 705 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  39.03 
 
 		 733 aa  478  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  38.96 
 
 		 741 aa  467  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0578  chemotaxis histidine kinase  38.13 
 
 		 714 aa  465  1e-129  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1317  CheA signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 		 733 aa  452  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.460815  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 		 686 aa  445  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 699 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0332  CheA signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 		 756 aa  439  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1533  CheA signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 750 aa  435  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037058 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0236  CheA signal transduction histidine kinases  56.39 
 
 		 654 aa  425  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1584  chemotaxis histidine protein kinase  56.39 
 
 		 654 aa  425  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.678464  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 		 688 aa  425  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 677 aa  414  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2478  CheA signal transduction histidine kinase  57.88 
 
 		 660 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54146  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1379  CheA signal transduction histidine kinase  57.34 
 
 		 658 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0851844  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1568  CheA signal transduction histidine kinase  36.35 
 
 		 739 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  36.25 
 
 		 703 aa  405  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 695 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 707 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 673 aa  390  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1209  CheA signal transduction histidine kinases  36.48 
 
 		 697 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 		 682 aa  388  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 747 aa  388  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  36.44 
 
 		 684 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 694 aa  384  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 702 aa  381  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  37.68 
 
 		 681 aa  382  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  38.08 
 
 		 717 aa  381  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  38.24 
 
 		 717 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  37.86 
 
 		 806 aa  382  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  33.29 
 
 		 675 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  36.45 
 
 		 720 aa  379  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 684 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  36.93 
 
 		 662 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  37.21 
 
 		 669 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  37.39 
 
 		 727 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  37.12 
 
 		 655 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  36.48 
 
 		 758 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  36.87 
 
 		 654 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 654 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  36.9 
 
 		 652 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  36.87 
 
 		 654 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 		 684 aa  369  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 666 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  36.87 
 
 		 654 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  36.87 
 
 		 654 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  36.87 
 
 		 652 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 759 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  36.87 
 
 		 654 aa  365  1e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  36.72 
 
 		 654 aa  365  1e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  36.8 
 
 		 669 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  36.71 
 
 		 669 aa  364  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  36.71 
 
 		 669 aa  364  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  36.71 
 
 		 669 aa  363  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  36.71 
 
 		 669 aa  363  8e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  32.88 
 
 		 927 aa  361  2e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 691 aa  360  4e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1446  CheA signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 760 aa  357  5.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3206  CheA signal transduction histidine kinases  33.92 
 
 		 711 aa  357  5.999999999999999e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  36.01 
 
 		 887 aa  356  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0330  CheA signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 758 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.362553  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 681 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0810  CheA signal transduction histidine kinases  31.59 
 
 		 715 aa  352  2e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  34.73 
 
 		 685 aa  351  3e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  33.38 
 
 		 729 aa  351  3e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0298  CheA signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 763 aa  349  9e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265941  normal  0.326442 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 660 aa  348  2e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 696 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5608  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  45.92 
 
 		 673 aa  346  8e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>