More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1009 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1009  chemotaxis protein CheA  100 
 
 		 761 aa  1549    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03242  chemotaxis protein CheA  49.05 
 
 		 913 aa  420  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2327  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  48.85 
 
 		 862 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 770 aa  365  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  42.19 
 
 		 927 aa  343  5.999999999999999e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  31.27 
 
 		 741 aa  342  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 695 aa  340  5.9999999999999996e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 		 1031 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  31.18 
 
 		 733 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1851  CheA signal transduction histidine kinase  46.13 
 
 		 814 aa  335  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  42.64 
 
 		 954 aa  334  4e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  43.94 
 
 		 1089 aa  332  1e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 1030 aa  324  4e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  29.96 
 
 		 720 aa  324  4e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  31.61 
 
 		 720 aa  320  7e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 732 aa  319  9e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 		 681 aa  319  1e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  41.5 
 
 		 673 aa  316  9e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 		 671 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 729 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  40.46 
 
 		 666 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 		 701 aa  310  6.999999999999999e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 		 671 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  41.12 
 
 		 713 aa  305  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 		 696 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 675 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  38.9 
 
 		 687 aa  305  2.0000000000000002e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 673 aa  302  1e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  41.33 
 
 		 701 aa  301  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  39.03 
 
 		 803 aa  299  2e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 674 aa  299  2e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  39.49 
 
 		 652 aa  298  2e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  40.05 
 
 		 603 aa  298  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  40.05 
 
 		 604 aa  297  6e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 		 666 aa  296  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  38.99 
 
 		 610 aa  295  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 745 aa  295  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 691 aa  295  3e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 		 655 aa  291  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0766  CheA signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 740 aa  291  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.675512  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4607  CheA signal transduction histidine kinases  40.1 
 
 		 752 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 709 aa  291  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 		 728 aa  291  4e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  37.88 
 
 		 1010 aa  291  4e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 558 aa  291  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  37.06 
 
 		 785 aa  290  6e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  37.31 
 
 		 783 aa  289  1e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  38.56 
 
 		 677 aa  289  1e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 		 719 aa  289  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 686 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  39.49 
 
 		 741 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 		 919 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 		 606 aa  287  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0755  CheA signal transduction histidine kinase  39.14 
 
 		 688 aa  286  8e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0128541 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 919 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1533  CheA signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 750 aa  286  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037058 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  40.05 
 
 		 607 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  37.6 
 
 		 685 aa  285  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 920 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  39.39 
 
 		 601 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 694 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 660 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 671 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  36.36 
 
 		 770 aa  284  4.0000000000000003e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0332  CheA signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 756 aa  284  5.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  36.41 
 
 		 667 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 691 aa  283  6.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  40 
 
 		 910 aa  283  6.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 		 743 aa  283  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3650  chemotaxis protein CheA  36.23 
 
 		 667 aa  283  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  37.41 
 
 		 774 aa  283  1e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 		 747 aa  282  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  36.17 
 
 		 667 aa  282  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  36.54 
 
 		 670 aa  282  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  36.65 
 
 		 672 aa  281  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  36.17 
 
 		 667 aa  282  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  36.54 
 
 		 670 aa  281  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  39.49 
 
 		 746 aa  281  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 688 aa  281  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 		 737 aa  281  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1856  CheA signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 		 658 aa  281  4e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  38.73 
 
 		 748 aa  281  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 747 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  38.73 
 
 		 753 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3301  CheA signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 640 aa  280  9e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.763924 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  39.03 
 
 		 652 aa  280  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2222  chemotaxis protein CheA  38.37 
 
 		 692 aa  279  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  37.6 
 
 		 714 aa  279  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  34.56 
 
 		 769 aa  279  1e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 		 690 aa  279  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 697 aa  279  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  37.41 
 
 		 734 aa  279  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  37.15 
 
 		 736 aa  279  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  36.22 
 
 		 769 aa  279  1e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 		 741 aa  279  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 656 aa  279  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 		 733 aa  278  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 		 746 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 		 686 aa  279  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 		 759 aa  278  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>