More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4607 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4607  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 		 752 aa  1460    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0766  CheA signal transduction histidine kinase  44.59 
 
 		 740 aa  482  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.675512  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1851  CheA signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 814 aa  461  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1009  chemotaxis protein CheA  31.81 
 
 		 761 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2327  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  42.71 
 
 		 862 aa  362  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03242  chemotaxis protein CheA  39.9 
 
 		 913 aa  335  3e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  28.27 
 
 		 677 aa  316  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1568  CheA signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 739 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  30.17 
 
 		 720 aa  309  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  31.45 
 
 		 720 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 		 1031 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  39.75 
 
 		 1089 aa  308  3e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 954 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 747 aa  303  5.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 713 aa  301  3e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3301  CheA signal transduction histidine kinase  41.01 
 
 		 640 aa  300  4e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.763924 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 		 660 aa  298  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  29.16 
 
 		 704 aa  296  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  28.78 
 
 		 733 aa  295  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 919 aa  292  1e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2093  CheA signal transduction histidine kinases  30.72 
 
 		 736 aa  292  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.768244 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 957 aa  290  9e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 681 aa  289  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  38.88 
 
 		 701 aa  288  4e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 687 aa  287  4e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 694 aa  287  5e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 770 aa  287  5.999999999999999e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  31.33 
 
 		 700 aa  286  8e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  28.07 
 
 		 741 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 		 920 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 919 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 712 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 732 aa  284  5.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 697 aa  284  5.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  37.44 
 
 		 806 aa  283  6.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1317  CheA signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 733 aa  281  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.460815  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  35.92 
 
 		 692 aa  281  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 702 aa  281  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2049  CheA signal transduction histidine kinase  46.09 
 
 		 761 aa  281  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144631 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 675 aa  280  8e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 652 aa  279  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3221  CheA signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 		 635 aa  278  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  29.99 
 
 		 682 aa  277  6e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 673 aa  277  7e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 698 aa  276  9e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  30.78 
 
 		 705 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 673 aa  275  2.0000000000000002e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  29.48 
 
 		 708 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 699 aa  275  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 650 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 666 aa  274  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 		 691 aa  274  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  29.72 
 
 		 681 aa  273  6e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 709 aa  273  7e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  33.4 
 
 		 927 aa  273  9e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 655 aa  273  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  34.99 
 
 		 770 aa  273  1e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 691 aa  271  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  35.82 
 
 		 767 aa  271  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0361  CheW-like protein  32.06 
 
 		 897 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30104  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 666 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1881  CheA signal transduction histidine kinases  38.76 
 
 		 736 aa  271  5e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.254979 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  37.02 
 
 		 610 aa  270  7e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  34.87 
 
 		 769 aa  270  1e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 671 aa  268  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 677 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4077  Chemotaxis protein histidine kinase  37.79 
 
 		 662 aa  269  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 		 696 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 688 aa  267  5e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 747 aa  267  5e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 		 724 aa  267  5e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 		 759 aa  267  5e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 598 aa  267  5.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 697 aa  267  7e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 671 aa  266  8.999999999999999e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1856  CheA signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 658 aa  266  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 719 aa  266  1e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  36.27 
 
 		 754 aa  266  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  34.14 
 
 		 769 aa  265  2e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 696 aa  265  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 558 aa  265  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0766  CheA signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 802 aa  265  2e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  30.68 
 
 		 758 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 652 aa  265  2e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 694 aa  265  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 695 aa  266  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  35.19 
 
 		 736 aa  265  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 759 aa  265  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 		 607 aa  265  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 604 aa  265  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  34.14 
 
 		 769 aa  265  3e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 741 aa  264  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 679 aa  264  4.999999999999999e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 747 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 649 aa  263  6.999999999999999e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 760 aa  263  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  28.36 
 
 		 703 aa  263  8e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  33.9 
 
 		 770 aa  263  8.999999999999999e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 728 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0988  CheA signal transduction histidine kinases  35.62 
 
 		 734 aa  263  8.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>