More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2327 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2327  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  100 
 
 		 862 aa  1707    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03242  chemotaxis protein CheA  35.13 
 
 		 913 aa  496  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1009  chemotaxis protein CheA  48.85 
 
 		 761 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1851  CheA signal transduction histidine kinase  48.63 
 
 		 814 aa  393  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4607  CheA signal transduction histidine kinases  48.08 
 
 		 752 aa  346  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 		 1031 aa  338  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  43.94 
 
 		 1089 aa  337  7.999999999999999e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  41.71 
 
 		 681 aa  332  1e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 701 aa  327  7e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 		 1030 aa  325  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 		 954 aa  324  3e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 		 696 aa  324  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  42.13 
 
 		 927 aa  325  3e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 770 aa  324  5e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  38.89 
 
 		 770 aa  320  1e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 		 558 aa  317  9e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0766  CheA signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 740 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.675512  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 713 aa  314  4.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 671 aa  312  1e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3301  CheA signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 		 640 aa  313  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.763924 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 		 673 aa  310  5.9999999999999995e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  39.28 
 
 		 785 aa  308  2.0000000000000002e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  39.28 
 
 		 783 aa  307  5.0000000000000004e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  40.41 
 
 		 774 aa  306  9.000000000000001e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  36.45 
 
 		 769 aa  305  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  36.45 
 
 		 769 aa  305  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  36.68 
 
 		 769 aa  305  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 695 aa  304  6.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 673 aa  303  7.000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 		 674 aa  303  1e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  39.09 
 
 		 677 aa  303  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 		 671 aa  302  1e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 687 aa  300  8e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  38.37 
 
 		 685 aa  300  9e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  38.8 
 
 		 598 aa  299  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  35.88 
 
 		 770 aa  298  3e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0988  CheA signal transduction histidine kinases  40.1 
 
 		 734 aa  297  5e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581275 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 652 aa  296  8e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 		 606 aa  296  8e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  38.4 
 
 		 610 aa  295  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 604 aa  295  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.07 
 
 		 754 aa  293  7e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 666 aa  293  8e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 603 aa  293  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  37.19 
 
 		 601 aa  293  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 759 aa  293  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 		 691 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  38.56 
 
 		 758 aa  290  6e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  38.3 
 
 		 748 aa  290  9e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 		 729 aa  290  9e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 739 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 743 aa  289  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 747 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 747 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 		 719 aa  288  2.9999999999999996e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0474  CheA signal transduction histidine kinases  39.45 
 
 		 739 aa  288  2.9999999999999996e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 691 aa  288  4e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  37.24 
 
 		 803 aa  287  8e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 		 1063 aa  286  9e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 		 746 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  37.4 
 
 		 762 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 746 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 		 607 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 747 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 747 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  38.38 
 
 		 748 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 741 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 741 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 733 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 738 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1771  CheA signal transduction histidine kinases  37.69 
 
 		 727 aa  285  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  36.62 
 
 		 736 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 655 aa  284  4.0000000000000003e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  37.47 
 
 		 801 aa  284  4.0000000000000003e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  37.14 
 
 		 760 aa  285  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  37.14 
 
 		 762 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3207  chemotaxis protein  37.14 
 
 		 758 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2049  CheA signal transduction histidine kinase  46.13 
 
 		 761 aa  284  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144631 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  38.56 
 
 		 753 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 		 728 aa  284  6.000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  36.93 
 
 		 1010 aa  284  6.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 		 697 aa  284  6.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 733 aa  284  6.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  36.65 
 
 		 734 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  36.5 
 
 		 744 aa  283  8.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 		 919 aa  283  9e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  40.05 
 
 		 614 aa  282  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 737 aa  282  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  36.7 
 
 		 744 aa  282  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 957 aa  282  2e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 		 666 aa  281  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  34.77 
 
 		 754 aa  281  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 920 aa  281  4e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 679 aa  281  5e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 660 aa  280  6e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 694 aa  280  7e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  37.4 
 
 		 767 aa  280  7e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 675 aa  280  8e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  36.83 
 
 		 785 aa  280  9e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  37.92 
 
 		 766 aa  279  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>