More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1851 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1851  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
814 aa  1580    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59721  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4607  CheA signal transduction histidine kinases  39.73 
 
 
752 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2327  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  50.92 
 
 
862 aa  421  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03242  chemotaxis protein CheA  48.7 
 
 
913 aa  413  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
770 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1009  chemotaxis protein CheA  45.41 
 
 
761 aa  356  1e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  32.68 
 
 
806 aa  342  1e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  41.18 
 
 
803 aa  340  7e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  42.2 
 
 
1031 aa  338  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  42.21 
 
 
1089 aa  333  1e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  42.71 
 
 
954 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0689  CheA  28.33 
 
 
864 aa  327  4.0000000000000003e-88  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0189722  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  39.46 
 
 
774 aa  322  9.999999999999999e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  41.15 
 
 
770 aa  317  4e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 
1030 aa  317  7e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 
694 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  38.2 
 
 
927 aa  313  4.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  40 
 
 
785 aa  313  5.999999999999999e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  39.08 
 
 
769 aa  313  6.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  36.4 
 
 
801 aa  313  7.999999999999999e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 
919 aa  313  7.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  38.43 
 
 
766 aa  313  7.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  40.05 
 
 
783 aa  312  2e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  43.54 
 
 
679 aa  311  2e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 
673 aa  310  5e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 
878 aa  310  6.999999999999999e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 
919 aa  310  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 
673 aa  310  1.0000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  38.57 
 
 
769 aa  308  3e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  38.39 
 
 
769 aa  307  4.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
677 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  42.63 
 
 
610 aa  307  5.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  38.93 
 
 
770 aa  307  6e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 
598 aa  306  7e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 
957 aa  306  8.000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 
681 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  40 
 
 
920 aa  305  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 
709 aa  305  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  40.05 
 
 
601 aa  304  5.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 
666 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 
724 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  39.14 
 
 
677 aa  303  8.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 
732 aa  303  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 
675 aa  302  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  41.77 
 
 
748 aa  301  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 
688 aa  301  4e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
697 aa  300  6e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  39.29 
 
 
736 aa  300  8e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  40.05 
 
 
729 aa  299  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  41.75 
 
 
728 aa  299  1e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 
687 aa  300  1e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3301  CheA signal transduction histidine kinase  43.11 
 
 
640 aa  299  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.763924 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  41.62 
 
 
753 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 
747 aa  298  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 
747 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 
671 aa  298  4e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 
558 aa  297  6e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 
674 aa  297  6e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  41.21 
 
 
743 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
701 aa  296  8e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 
606 aa  296  8e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
696 aa  296  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  38.6 
 
 
751 aa  296  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  35.73 
 
 
670 aa  295  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 
935 aa  295  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 
759 aa  295  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 
671 aa  295  3e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 
691 aa  294  3e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 
713 aa  294  4e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 
739 aa  294  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
660 aa  294  5e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  36.85 
 
 
604 aa  294  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1771  CheA signal transduction histidine kinases  40.93 
 
 
727 aa  294  5e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  37.76 
 
 
754 aa  294  5e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 
607 aa  293  9e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 
650 aa  293  9e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  40.6 
 
 
748 aa  293  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  35.7 
 
 
670 aa  293  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  40.6 
 
 
758 aa  292  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  39.3 
 
 
767 aa  292  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 
666 aa  292  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  35.43 
 
 
667 aa  291  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  35.43 
 
 
667 aa  291  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  36.21 
 
 
667 aa  291  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  40.45 
 
 
754 aa  291  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 
1063 aa  291  4e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 
745 aa  291  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
921 aa  291  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 
603 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 
695 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  35.03 
 
 
672 aa  290  9e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  37.41 
 
 
714 aa  290  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 
691 aa  289  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 
737 aa  289  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  39.28 
 
 
671 aa  289  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  40.72 
 
 
704 aa  289  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 
728 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 
937 aa  289  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 
747 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2176  CheA signal transduction histidine kinases  41.97 
 
 
709 aa  288  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749003  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>