More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3301 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3301  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
640 aa  1250    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.763924 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0766  CheA signal transduction histidine kinase  48.99 
 
 
740 aa  327  5e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.675512  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2327  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  43.78 
 
 
862 aa  316  9e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
649 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2049  CheA signal transduction histidine kinase  48.7 
 
 
761 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144631 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 
687 aa  301  2e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4607  CheA signal transduction histidine kinases  42.34 
 
 
752 aa  301  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03242  chemotaxis protein CheA  37.94 
 
 
913 aa  296  8e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  29.55 
 
 
769 aa  295  1e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  29.94 
 
 
769 aa  293  5e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  31.1 
 
 
720 aa  293  7e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  30.42 
 
 
770 aa  292  1e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  29.95 
 
 
769 aa  292  1e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 
1031 aa  289  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  38.52 
 
 
1089 aa  288  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
681 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 
713 aa  288  2.9999999999999996e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 
675 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  28.55 
 
 
666 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 
954 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 
655 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  29.31 
 
 
770 aa  284  3.0000000000000004e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 
598 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1009  chemotaxis protein CheA  37.56 
 
 
761 aa  283  6.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1851  CheA signal transduction histidine kinase  42.63 
 
 
814 aa  281  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59721  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 
770 aa  280  5e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 
653 aa  280  7e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  36.95 
 
 
751 aa  279  9e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 
919 aa  279  1e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
919 aa  279  1e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1856  CheA signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 
658 aa  278  2e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  29.88 
 
 
660 aa  277  4e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  28.7 
 
 
677 aa  277  5e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  27.21 
 
 
667 aa  276  6e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  27.21 
 
 
667 aa  276  6e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  27.69 
 
 
670 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  28.24 
 
 
667 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 
920 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  36.32 
 
 
803 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  27.69 
 
 
670 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
957 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 
1030 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  36.68 
 
 
754 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3650  chemotaxis protein CheA  27.64 
 
 
667 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 
660 aa  273  8.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 
652 aa  272  2e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  27.87 
 
 
672 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 
650 aa  272  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  35.75 
 
 
774 aa  272  2e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  36.18 
 
 
714 aa  271  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  35.28 
 
 
785 aa  269  1e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  35.01 
 
 
736 aa  268  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2574  CheA signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
661 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.12503  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 
759 aa  268  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 
709 aa  268  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  30.09 
 
 
700 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1209  CheA signal transduction histidine kinases  32.47 
 
 
697 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
702 aa  267  4e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  37.22 
 
 
748 aa  267  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  26.24 
 
 
673 aa  266  5.999999999999999e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  35.26 
 
 
783 aa  266  8.999999999999999e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  36.2 
 
 
748 aa  266  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
666 aa  266  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  37.19 
 
 
692 aa  266  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 
796 aa  265  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  29.93 
 
 
705 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1379  CheA signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 
658 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0851844  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  37.18 
 
 
753 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1336  CheA signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 
657 aa  264  3e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280744  normal  0.428976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  36.2 
 
 
758 aa  265  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 
691 aa  263  6.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.41 
 
 
754 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0988  CheA signal transduction histidine kinases  36.36 
 
 
734 aa  262  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.581275 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0942  CheA signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
670 aa  261  2e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
746 aa  262  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 
1063 aa  261  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  35.2 
 
 
744 aa  261  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  35.63 
 
 
744 aa  261  4e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 
741 aa  261  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
652 aa  260  5.0000000000000005e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
733 aa  260  6e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
746 aa  260  6e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  34.33 
 
 
734 aa  260  6e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
738 aa  260  7e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  28.31 
 
 
720 aa  259  7e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0474  CheA signal transduction histidine kinases  35.59 
 
 
739 aa  260  7e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
747 aa  259  9e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
747 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
684 aa  259  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
741 aa  259  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3221  CheA signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 
635 aa  259  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  36.79 
 
 
610 aa  258  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
747 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
694 aa  258  2e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  34.87 
 
 
762 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 
743 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
739 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
698 aa  258  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
745 aa  257  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  29.71 
 
 
703 aa  257  4e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>