More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0766 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0766  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
740 aa  1393    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.675512  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4607  CheA signal transduction histidine kinases  44.59 
 
 
752 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2049  CheA signal transduction histidine kinase  68.61 
 
 
761 aa  428  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144631 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1851  CheA signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 
814 aa  395  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59721  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3301  CheA signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 
640 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.763924 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1009  chemotaxis protein CheA  32.21 
 
 
761 aa  376  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2327  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  40.2 
 
 
862 aa  319  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 
919 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 
919 aa  305  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  31.71 
 
 
700 aa  301  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 
920 aa  298  3e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  31.32 
 
 
705 aa  296  9e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03242  chemotaxis protein CheA  37.28 
 
 
913 aa  295  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
732 aa  295  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1568  CheA signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
739 aa  289  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1856  CheA signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 
658 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 
957 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
694 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  29.31 
 
 
733 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  30.85 
 
 
685 aa  283  8.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  30.04 
 
 
720 aa  281  3e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 
1031 aa  279  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 
954 aa  279  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  30.23 
 
 
720 aa  278  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
598 aa  277  5e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1317  CheA signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
733 aa  276  8e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.460815  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  26.62 
 
 
697 aa  275  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  36.82 
 
 
1089 aa  273  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
759 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  34.15 
 
 
774 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 
660 aa  269  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
603 aa  268  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 
701 aa  268  2.9999999999999995e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  31.99 
 
 
708 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
604 aa  267  5.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
558 aa  266  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
713 aa  265  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
679 aa  264  4e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  32.02 
 
 
770 aa  263  1e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  37.91 
 
 
610 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 
649 aa  261  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 
729 aa  262  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 
681 aa  262  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0766  CheA signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 
802 aa  262  2e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1336  CheA signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 
657 aa  261  4e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280744  normal  0.428976 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  28.14 
 
 
654 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
712 aa  261  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
654 aa  260  6e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
709 aa  260  7e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  28.14 
 
 
652 aa  260  8e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  25.12 
 
 
801 aa  259  9e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  28.28 
 
 
654 aa  259  9e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  28.14 
 
 
654 aa  259  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
652 aa  259  1e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  28.14 
 
 
654 aa  259  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  28.14 
 
 
654 aa  259  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  34.34 
 
 
927 aa  259  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  28.14 
 
 
652 aa  259  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 
607 aa  258  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
650 aa  258  2e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
747 aa  258  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  35.14 
 
 
1010 aa  259  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  33.83 
 
 
677 aa  258  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  27.22 
 
 
670 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3221  CheA signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
635 aa  258  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  28.01 
 
 
654 aa  258  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  26.95 
 
 
670 aa  258  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  26.26 
 
 
667 aa  258  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  26.12 
 
 
667 aa  258  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  29.17 
 
 
662 aa  258  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
745 aa  258  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0332  CheA signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
756 aa  258  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  26.26 
 
 
667 aa  258  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
682 aa  258  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
666 aa  258  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0958  CheA signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
1286 aa  257  5e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  29.33 
 
 
741 aa  256  8e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
686 aa  256  8e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 
699 aa  256  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  34.67 
 
 
767 aa  256  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3206  CheA signal transduction histidine kinases  29.47 
 
 
711 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136095  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  35.7 
 
 
748 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  29.82 
 
 
681 aa  255  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  35.73 
 
 
660 aa  254  3e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  35.64 
 
 
754 aa  255  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  30.09 
 
 
703 aa  254  3e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 
691 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
691 aa  254  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  35.9 
 
 
751 aa  254  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 
698 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  32.93 
 
 
783 aa  254  5.000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
687 aa  254  5.000000000000001e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 
702 aa  254  6e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 
684 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  34.33 
 
 
744 aa  253  9.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
747 aa  253  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  29.48 
 
 
669 aa  253  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
743 aa  253  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  34.83 
 
 
744 aa  253  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1881  CheA signal transduction histidine kinases  29.92 
 
 
736 aa  253  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.254979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>