More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2049 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2049  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
761 aa  1391    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0766  CheA signal transduction histidine kinase  62.45 
 
 
740 aa  737    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.675512  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4607  CheA signal transduction histidine kinases  43.28 
 
 
752 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1851  CheA signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 
814 aa  398  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59721  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1009  chemotaxis protein CheA  32.36 
 
 
761 aa  375  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3301  CheA signal transduction histidine kinase  47.67 
 
 
640 aa  326  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.763924 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2327  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.87 
 
 
862 aa  323  5e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03242  chemotaxis protein CheA  37.05 
 
 
913 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  40.51 
 
 
1089 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 
954 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 
1031 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 
701 aa  299  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 
1030 aa  293  8e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  27.81 
 
 
754 aa  290  8e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  31.23 
 
 
720 aa  287  5.999999999999999e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 
696 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 
919 aa  284  5.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
713 aa  283  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 
957 aa  283  1e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  39.03 
 
 
610 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 
604 aa  282  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 
598 aa  281  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 
603 aa  281  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  35.71 
 
 
927 aa  278  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1568  CheA signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
739 aa  277  5e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
660 aa  276  7e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  36.94 
 
 
601 aa  275  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
919 aa  273  7e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0577  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 
556 aa  273  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.482834  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  39.54 
 
 
607 aa  273  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 
920 aa  273  1e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
649 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 
606 aa  270  5e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  34.56 
 
 
783 aa  270  5.9999999999999995e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 
681 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
770 aa  268  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  34.08 
 
 
770 aa  269  2e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
673 aa  269  2e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
655 aa  268  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  34.31 
 
 
785 aa  268  4e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  34.8 
 
 
774 aa  267  5e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  34.74 
 
 
770 aa  266  8.999999999999999e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  33.5 
 
 
769 aa  266  1e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  33.5 
 
 
769 aa  266  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 
666 aa  265  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 
729 aa  265  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3221  CheA signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 
635 aa  265  4e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 
691 aa  264  4e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  33.25 
 
 
769 aa  264  4.999999999999999e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
709 aa  263  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  37.93 
 
 
801 aa  262  2e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  34.04 
 
 
803 aa  262  2e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
695 aa  261  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  34.45 
 
 
677 aa  261  3e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 
679 aa  261  4e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  36.53 
 
 
692 aa  260  8e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 
709 aa  259  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
732 aa  258  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
675 aa  258  3e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 
558 aa  258  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  27.86 
 
 
733 aa  257  5e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3199  chemotaxis protein CheA  41.36 
 
 
561 aa  256  9e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 
652 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
666 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
671 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1317  CheA signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 
733 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.460815  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 
745 aa  254  4.0000000000000004e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
673 aa  254  5.000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  36.18 
 
 
639 aa  253  6e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
650 aa  253  9.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0958  CheA signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
1286 aa  253  9.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0433  CheA signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 
730 aa  253  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.645464  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
697 aa  253  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  36.64 
 
 
748 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  37.6 
 
 
720 aa  251  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  42.12 
 
 
614 aa  252  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  34.51 
 
 
744 aa  251  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  35.82 
 
 
751 aa  251  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  34.32 
 
 
1010 aa  251  4e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
719 aa  251  4e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
694 aa  251  5e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
759 aa  251  5e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  34.01 
 
 
744 aa  250  7e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0474  CheA signal transduction histidine kinases  36.78 
 
 
739 aa  250  8e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0628  CheA signal transduction histidine kinase  41.97 
 
 
553 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
687 aa  249  1e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
1063 aa  249  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0942  CheA signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 
670 aa  249  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  35.4 
 
 
736 aa  249  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0637  CheA signal transduction histidine kinase  41.97 
 
 
551 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  33.67 
 
 
723 aa  248  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
746 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 
686 aa  248  3e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 
741 aa  248  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  36.23 
 
 
734 aa  248  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  35.9 
 
 
660 aa  248  3e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0689  CheA  35.92 
 
 
864 aa  248  4e-64  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0189722  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
738 aa  248  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0603  CheA signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 
551 aa  248  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
747 aa  248  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>