More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03242 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03242  chemotaxis protein CheA  100 
 
 		 913 aa  1860    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1009  chemotaxis protein CheA  49.05 
 
 		 761 aa  420  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2327  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  47.7 
 
 		 862 aa  413  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1851  CheA signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 814 aa  387  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  39.13 
 
 		 1089 aa  325  3e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 770 aa  321  3e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4607  CheA signal transduction histidine kinases  41.18 
 
 		 752 aa  319  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 954 aa  319  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 		 1031 aa  317  8e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 1030 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  40.6 
 
 		 927 aa  308  3e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 696 aa  303  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 671 aa  301  4e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 701 aa  298  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  37 
 
 		 754 aa  297  7e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 		 919 aa  295  2e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 919 aa  295  2e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 		 671 aa  296  2e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  35.06 
 
 		 769 aa  295  3e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 673 aa  294  4e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  34.23 
 
 		 769 aa  294  6e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  34.23 
 
 		 769 aa  294  6e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  33.55 
 
 		 770 aa  293  1e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0766  CheA signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 740 aa  293  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.675512  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3301  CheA signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 		 640 aa  293  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.763924 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 673 aa  293  1e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 920 aa  292  2e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 		 691 aa  292  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 733 aa  291  3e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  35.4 
 
 		 803 aa  291  3e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 655 aa  291  4e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 666 aa  290  6e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  36.71 
 
 		 736 aa  290  6e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 745 aa  290  8e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 		 691 aa  290  8e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 746 aa  290  9e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 		 741 aa  290  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 957 aa  289  1e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 		 715 aa  290  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 687 aa  290  1e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 733 aa  289  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 		 713 aa  288  2.9999999999999996e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  35.52 
 
 		 770 aa  288  2.9999999999999996e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  36.38 
 
 		 598 aa  288  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 		 652 aa  287  5e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 759 aa  288  5e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  35.96 
 
 		 785 aa  286  2.0000000000000002e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  36.78 
 
 		 734 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 		 674 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 709 aa  285  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  33.18 
 
 		 774 aa  285  3.0000000000000004e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 650 aa  284  6.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  35.09 
 
 		 783 aa  283  8.000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  36.49 
 
 		 744 aa  283  8.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 		 746 aa  283  9e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  37.22 
 
 		 758 aa  283  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 		 747 aa  283  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0361  CheW-like protein  37.53 
 
 		 897 aa  283  1e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30104  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 		 747 aa  283  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 		 738 aa  282  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  36.9 
 
 		 751 aa  282  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  37.15 
 
 		 762 aa  282  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0988  CheA signal transduction histidine kinases  38.05 
 
 		 734 aa  282  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581275 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0474  CheA signal transduction histidine kinases  37.34 
 
 		 739 aa  282  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  36.97 
 
 		 748 aa  281  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3207  chemotaxis protein  37.15 
 
 		 758 aa  281  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2049  CheA signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 761 aa  281  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144631 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 		 741 aa  281  4e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  36.9 
 
 		 760 aa  280  6e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  36.9 
 
 		 762 aa  281  6e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  37.15 
 
 		 767 aa  279  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2736  CheA signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 687 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 603 aa  278  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 747 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2828  CheA signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 		 685 aa  278  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 		 743 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1771  CheA signal transduction histidine kinases  35.43 
 
 		 727 aa  278  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  37.5 
 
 		 744 aa  278  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3299  CheA signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 671 aa  278  4e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 747 aa  277  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  36.41 
 
 		 714 aa  278  5e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2920  CheA signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 		 685 aa  278  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.038084  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 		 604 aa  277  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 737 aa  277  7e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  36.91 
 
 		 677 aa  277  8e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 695 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 681 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 739 aa  275  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  36.3 
 
 		 670 aa  274  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 697 aa  274  5.000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 660 aa  274  6e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  36.91 
 
 		 610 aa  273  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 694 aa  273  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 701 aa  273  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 558 aa  272  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  37.95 
 
 		 720 aa  272  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0984  chemotaxis sensor histidine kinase  35.75 
 
 		 598 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  36.65 
 
 		 552 aa  272  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  36.65 
 
 		 552 aa  272  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1414  CheA signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 664 aa  271  4e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>