More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3350 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 2012 aa  768    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  55.89 
 
 		 2026 aa  1125    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  37.03 
 
 		 1866 aa  690    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  41.8 
 
 		 1956 aa  718    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.35 
 
 		 1960 aa  709    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  56.6 
 
 		 2026 aa  1129    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 		 2009 aa  769    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  54.69 
 
 		 1888 aa  1923    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  53.44 
 
 		 2092 aa  1038    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  73.64 
 
 		 2070 aa  1135    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  41.96 
 
 		 1989 aa  724    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  64.45 
 
 		 1983 aa  993    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  63.49 
 
 		 2414 aa  779    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  66.94 
 
 		 2137 aa  833    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  63.3 
 
 		 2022 aa  989    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  57.07 
 
 		 2164 aa  1142    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 		 1970 aa  3994    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  36.16 
 
 		 1643 aa  588  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  49.03 
 
 		 1907 aa  579  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 2539 aa  521  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  38.9 
 
 		 2336 aa  512  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 2212 aa  496  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  42.36 
 
 		 1974 aa  493  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 2423 aa  491  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  36.9 
 
 		 2301 aa  491  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 1832 aa  483  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  36.42 
 
 		 2458 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  36.05 
 
 		 2476 aa  477  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 1725 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 1758 aa  473  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 		 1725 aa  467  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0518  CheA signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 2175 aa  469  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.09 
 
 		 1971 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  35.36 
 
 		 1992 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 1629 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  34.81 
 
 		 1987 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  39.43 
 
 		 1834 aa  444  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  35.89 
 
 		 2301 aa  436  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 1646 aa  433  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 1646 aa  433  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 1647 aa  431  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 1609 aa  426  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  34.52 
 
 		 2284 aa  414  1e-113  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.91 
 
 		 2325 aa  325  8e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 1127 aa  310  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 934 aa  306  3.0000000000000004e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 911 aa  305  5.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 1155 aa  303  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 1616 aa  302  4e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 1137 aa  297  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 740 aa  296  3e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 1125 aa  296  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 1098 aa  291  6e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 1065 aa  290  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 		 1098 aa  290  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 928 aa  286  2.0000000000000002e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 		 952 aa  284  1e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  31 
 
 		 1197 aa  281  6e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.43 
 
 		 974 aa  280  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 679 aa  279  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 941 aa  279  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 679 aa  278  6e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.65 
 
 		 1180 aa  278  8e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 741 aa  277  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 1736 aa  276  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 762 aa  275  8.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 977 aa  273  2.9999999999999997e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  27.57 
 
 		 798 aa  272  5e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 742 aa  270  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 1012 aa  270  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 784 aa  270  2.9999999999999995e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  34 
 
 		 878 aa  266  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 1078 aa  264  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  27.52 
 
 		 734 aa  259  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 974 aa  259  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0519  putative CheA signal transduction histidine kinases  29.54 
 
 		 1029 aa  258  8e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  32.99 
 
 		 785 aa  255  6e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 777 aa  255  6e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  32.59 
 
 		 774 aa  255  8.000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 777 aa  254  1e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 783 aa  253  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  31.36 
 
 		 770 aa  250  2e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  32.73 
 
 		 770 aa  248  9.999999999999999e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  32.05 
 
 		 783 aa  248  9.999999999999999e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  31.25 
 
 		 803 aa  246  3e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  28.66 
 
 		 764 aa  245  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 		 989 aa  241  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  32.39 
 
 		 769 aa  240  2e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 		 989 aa  240  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  32.39 
 
 		 769 aa  241  2e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0469  CheA signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 830 aa  240  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153889  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  34.59 
 
 		 839 aa  239  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  32.59 
 
 		 769 aa  239  5.0000000000000005e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0714  CheA signal transduction histidine kinases  26.69 
 
 		 1020 aa  238  9e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  32.64 
 
 		 793 aa  238  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  32.3 
 
 		 789 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 756 aa  238  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  28.54 
 
 		 769 aa  235  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  28.67 
 
 		 752 aa  235  6e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  27.26 
 
 		 772 aa  235  7.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>