More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_05390 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  46.8 
 
 
1646 aa  896    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  46.61 
 
 
1646 aa  891    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  55.01 
 
 
1987 aa  1053    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  54.22 
 
 
1992 aa  1050    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  41.02 
 
 
2284 aa  700    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  94.14 
 
 
2458 aa  4430    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 
1758 aa  736    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  49.84 
 
 
1971 aa  734    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  46.41 
 
 
1647 aa  893    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  56.76 
 
 
2336 aa  840    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  46.91 
 
 
2212 aa  642    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  43.18 
 
 
2301 aa  735    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  38.99 
 
 
1834 aa  656    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  100 
 
 
2476 aa  4856    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  66.56 
 
 
1629 aa  794    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  68.1 
 
 
2423 aa  2191    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  48.69 
 
 
2539 aa  1042    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  45.94 
 
 
2301 aa  627  1e-178  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  41.01 
 
 
1609 aa  625  1e-177  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  44.78 
 
 
1832 aa  616  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 
1725 aa  599  1e-169  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 
1725 aa  600  1e-169  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.89 
 
 
1960 aa  521  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  39.52 
 
 
1866 aa  520  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  39.95 
 
 
2048 aa  516  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 
2009 aa  512  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0518  CheA signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 
2175 aa  512  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  39.14 
 
 
2012 aa  506  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  37.51 
 
 
1956 aa  496  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  38.64 
 
 
1989 aa  496  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  38.81 
 
 
1888 aa  493  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 
2026 aa  489  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 
2164 aa  489  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  38.57 
 
 
2026 aa  486  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  36.71 
 
 
1970 aa  483  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  37.86 
 
 
1983 aa  481  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  37.61 
 
 
1643 aa  475  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  41.63 
 
 
2092 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  42.27 
 
 
2414 aa  468  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
2022 aa  455  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  40.29 
 
 
2070 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 
2137 aa  448  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
1974 aa  347  2e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 
1127 aa  338  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
934 aa  332  4e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.33 
 
 
2325 aa  332  5.0000000000000004e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.16 
 
 
1180 aa  332  6e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0519  putative CheA signal transduction histidine kinases  29.27 
 
 
1029 aa  332  6e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
1616 aa  323  3e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 
1065 aa  321  9e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
1098 aa  320  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
1155 aa  318  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  30.28 
 
 
769 aa  317  1.9999999999999998e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
1098 aa  316  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  29.24 
 
 
769 aa  315  5.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
755 aa  315  9e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
1078 aa  312  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  30 
 
 
769 aa  312  5.9999999999999995e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 
1012 aa  312  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
952 aa  311  1.0000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  35.09 
 
 
785 aa  308  8.000000000000001e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  34.8 
 
 
803 aa  308  1.0000000000000001e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.55 
 
 
764 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  35.04 
 
 
770 aa  306  3.0000000000000004e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  31.98 
 
 
1197 aa  306  3.0000000000000004e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  34.48 
 
 
783 aa  305  6.000000000000001e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  31.87 
 
 
764 aa  304  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  31.84 
 
 
768 aa  302  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  33.86 
 
 
752 aa  301  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  37.38 
 
 
789 aa  301  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 
977 aa  301  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  31.51 
 
 
769 aa  301  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  35.21 
 
 
774 aa  299  4e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.71 
 
 
974 aa  299  5e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 
765 aa  299  6e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 
762 aa  296  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 
767 aa  296  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
928 aa  296  4e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  35.87 
 
 
793 aa  295  8e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
911 aa  294  2e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
1125 aa  293  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  35.09 
 
 
878 aa  293  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 
770 aa  292  6e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
1137 aa  291  8e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 
741 aa  291  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
740 aa  289  4e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 
804 aa  289  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 
742 aa  289  5.999999999999999e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 
974 aa  289  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 
1736 aa  287  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  29.19 
 
 
770 aa  287  2.0000000000000002e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  27.53 
 
 
801 aa  286  3.0000000000000004e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.88 
 
 
864 aa  284  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.88 
 
 
864 aa  284  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.88 
 
 
864 aa  284  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.88 
 
 
864 aa  284  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
679 aa  284  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  31.88 
 
 
864 aa  283  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0714  CheA signal transduction histidine kinases  32.67 
 
 
1020 aa  283  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  31.88 
 
 
864 aa  283  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>