More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4622 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  62.88 
 
 
2137 aa  915    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  42.29 
 
 
2048 aa  728    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  45.39 
 
 
1866 aa  641    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  44.09 
 
 
2009 aa  710    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  58.63 
 
 
1888 aa  1112    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  67.21 
 
 
2070 aa  1010    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  64.96 
 
 
1983 aa  962    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  47.8 
 
 
1989 aa  662    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  45.31 
 
 
2026 aa  856    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
2022 aa  4013    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  59.05 
 
 
2414 aa  885    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 
2012 aa  714    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  47.02 
 
 
2092 aa  1602    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  65.5 
 
 
2164 aa  983    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  63.46 
 
 
1970 aa  983    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  66.33 
 
 
2026 aa  984    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.85 
 
 
1960 aa  606  1.0000000000000001e-171  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  50.81 
 
 
1907 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  45.66 
 
 
1643 aa  547  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 
2212 aa  516  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  38.55 
 
 
2336 aa  510  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  39.79 
 
 
2301 aa  513  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 
2539 aa  500  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
1725 aa  478  1e-133  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 
1725 aa  480  1e-133  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.99 
 
 
1971 aa  467  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  36.91 
 
 
2458 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  35.49 
 
 
2423 aa  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 
1832 aa  461  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  36.98 
 
 
2476 aa  460  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 
1974 aa  459  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 
1758 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  35.07 
 
 
1987 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  34.95 
 
 
1992 aa  436  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
1609 aa  436  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  33.05 
 
 
2301 aa  428  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0518  CheA signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
2175 aa  429  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
1646 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 
1646 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 
1647 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  33 
 
 
2284 aa  409  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  38.88 
 
 
1629 aa  410  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
1155 aa  328  7e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.09 
 
 
2325 aa  326  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
934 aa  306  2.0000000000000002e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
1127 aa  306  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 
1616 aa  301  6e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  27.17 
 
 
974 aa  293  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 
952 aa  292  4e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
928 aa  292  5.0000000000000004e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
740 aa  290  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
911 aa  284  1e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 
1065 aa  283  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
977 aa  281  7e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
1125 aa  280  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  28.91 
 
 
734 aa  280  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 
1137 aa  279  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
1736 aa  276  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  30 
 
 
1098 aa  275  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.49 
 
 
1180 aa  273  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 
784 aa  273  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 
1098 aa  271  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
1012 aa  270  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
941 aa  269  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
989 aa  268  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 
989 aa  266  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
1078 aa  266  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  29.82 
 
 
1197 aa  264  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
741 aa  263  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 
783 aa  261  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 
742 aa  256  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
762 aa  254  8.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  32.66 
 
 
770 aa  251  7e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
777 aa  251  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  32.19 
 
 
783 aa  250  2e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  32.39 
 
 
769 aa  249  4e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  32.39 
 
 
769 aa  249  6e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  32.19 
 
 
785 aa  248  6e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  29.82 
 
 
798 aa  248  6e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  28 
 
 
777 aa  248  6.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  32.59 
 
 
769 aa  248  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  32.39 
 
 
770 aa  246  3e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
772 aa  246  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  31 
 
 
803 aa  244  1e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  32.74 
 
 
774 aa  244  1e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
679 aa  243  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0714  CheA signal transduction histidine kinases  26.58 
 
 
1020 aa  244  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
679 aa  241  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  29.58 
 
 
878 aa  238  7e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
777 aa  238  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 
781 aa  237  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
705 aa  237  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 
974 aa  235  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
705 aa  234  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  29.93 
 
 
764 aa  233  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3136  CheA signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 
649 aa  232  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382319  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4348  CheA signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 
911 aa  232  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
756 aa  232  7e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4288  CheA signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 
911 aa  232  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  27.29 
 
 
804 aa  228  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>