More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1014 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  54.92 
 
 		 2325 aa  730    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 928 aa  1864    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  55.27 
 
 		 1127 aa  717    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  53.94 
 
 		 1616 aa  680    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  56.29 
 
 		 1098 aa  729    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  56.14 
 
 		 1098 aa  726    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  51.23 
 
 		 1197 aa  650    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  56.77 
 
 		 1155 aa  722    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 977 aa  434  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.19 
 
 		 974 aa  424  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 1736 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 1137 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 1125 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  37.48 
 
 		 1012 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 1065 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 1078 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 941 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 974 aa  363  6e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0714  CheA signal transduction histidine kinases  31.48 
 
 		 1020 aa  351  3e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.1 
 
 		 1960 aa  338  2.9999999999999997e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.12 
 
 		 1180 aa  332  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 989 aa  326  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 989 aa  325  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 2414 aa  320  9e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  33.07 
 
 		 1866 aa  313  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  33.33 
 
 		 1989 aa  312  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  32.92 
 
 		 1956 aa  307  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 2212 aa  307  6e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 1725 aa  303  7.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  33.28 
 
 		 1834 aa  303  7.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  32.97 
 
 		 2301 aa  302  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 2539 aa  301  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 1725 aa  300  7e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  32.11 
 
 		 1643 aa  300  8e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  33.54 
 
 		 2048 aa  299  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4348  CheA signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 911 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4288  CheA signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 911 aa  298  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 2009 aa  296  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  33.49 
 
 		 2092 aa  295  3e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  31.07 
 
 		 2476 aa  295  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 2164 aa  295  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.97 
 
 		 1971 aa  294  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 2012 aa  295  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 1907 aa  293  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  30.96 
 
 		 2458 aa  293  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  30.32 
 
 		 2336 aa  292  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 		 2423 aa  290  6e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 		 2022 aa  290  6e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  33.39 
 
 		 1832 aa  290  7e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 934 aa  289  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  30.07 
 
 		 1987 aa  289  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  31.26 
 
 		 1974 aa  287  5e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  30.11 
 
 		 2070 aa  286  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  29.69 
 
 		 1970 aa  286  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  30.35 
 
 		 1983 aa  285  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 		 2137 aa  285  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  31.14 
 
 		 2301 aa  284  6.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  33.93 
 
 		 770 aa  281  3e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  30.71 
 
 		 2026 aa  281  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  27 
 
 		 1992 aa  281  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 1646 aa  281  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 1646 aa  281  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 1647 aa  280  7e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  30.61 
 
 		 1888 aa  280  8e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 2026 aa  280  9e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  34.48 
 
 		 785 aa  280  1e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  30.12 
 
 		 2284 aa  278  4e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 1758 aa  278  5e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 1629 aa  277  7e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  35.28 
 
 		 774 aa  275  4.0000000000000004e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  34.07 
 
 		 783 aa  274  6e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 911 aa  273  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  33.27 
 
 		 769 aa  270  1e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  34.05 
 
 		 803 aa  269  2e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  32.44 
 
 		 770 aa  268  4e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  35.22 
 
 		 769 aa  267  5.999999999999999e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  35.02 
 
 		 769 aa  267  8e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 1609 aa  267  8e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 781 aa  256  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0519  putative CheA signal transduction histidine kinases  29.88 
 
 		 1029 aa  252  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 777 aa  252  3e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  31.2 
 
 		 764 aa  250  9e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 762 aa  249  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  26.51 
 
 		 878 aa  248  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 		 783 aa  247  6.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.15 
 
 		 764 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 896 aa  245  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 896 aa  245  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  29.7 
 
 		 734 aa  244  3.9999999999999997e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 679 aa  243  9e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 760 aa  243  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 741 aa  241  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  34.37 
 
 		 752 aa  241  5e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  33.4 
 
 		 864 aa  241  5e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  33.4 
 
 		 864 aa  241  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 772 aa  241  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 755 aa  241  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  33.4 
 
 		 864 aa  241  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  33.4 
 
 		 864 aa  241  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  33.4 
 
 		 864 aa  240  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>