More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2900 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  39.09 
 
 		 1987 aa  738    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  45.8 
 
 		 2301 aa  697    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  43.83 
 
 		 1992 aa  729    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  45.7 
 
 		 1725 aa  685    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 		 1758 aa  732    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  54.39 
 
 		 1971 aa  657    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1974 aa  3916    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  54.11 
 
 		 2212 aa  649    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  56.8 
 
 		 2336 aa  693    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  48.32 
 
 		 2539 aa  786    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  43.86 
 
 		 1832 aa  740    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  44.72 
 
 		 1834 aa  761    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  59.28 
 
 		 2423 aa  726    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  45.7 
 
 		 1725 aa  687    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  54.2 
 
 		 1646 aa  632  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  54.04 
 
 		 1646 aa  631  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  54.2 
 
 		 1647 aa  631  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  38.78 
 
 		 2301 aa  626  1e-177  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  54.08 
 
 		 1629 aa  622  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  37.74 
 
 		 2284 aa  592  1e-167  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  39.7 
 
 		 1609 aa  579  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  46.06 
 
 		 1866 aa  561  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0518  CheA signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 2175 aa  546  1e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  46.83 
 
 		 1907 aa  536  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  43.41 
 
 		 2048 aa  524  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  37.17 
 
 		 1970 aa  522  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  44.55 
 
 		 1989 aa  520  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  37.19 
 
 		 1888 aa  515  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 2009 aa  516  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  44.75 
 
 		 1956 aa  512  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  42.16 
 
 		 2070 aa  513  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  44.3 
 
 		 1960 aa  510  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  43.07 
 
 		 1643 aa  503  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 2414 aa  502  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  42.93 
 
 		 2026 aa  495  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  42.93 
 
 		 2026 aa  492  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 		 2164 aa  486  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  42.21 
 
 		 2137 aa  480  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 		 2022 aa  459  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 		 1155 aa  356  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  36.81 
 
 		 2476 aa  351  8e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.71 
 
 		 2325 aa  350  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  30.85 
 
 		 770 aa  348  4e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  31.11 
 
 		 769 aa  348  5e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  30.6 
 
 		 769 aa  348  8e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 1065 aa  346  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  30.8 
 
 		 769 aa  345  5.999999999999999e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 1078 aa  342  5e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  36.08 
 
 		 2458 aa  341  9e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  30.83 
 
 		 774 aa  340  1.9999999999999998e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 1616 aa  340  1.9999999999999998e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  30.48 
 
 		 803 aa  339  3.9999999999999995e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 1127 aa  337  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 952 aa  336  2e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.92 
 
 		 974 aa  328  4.0000000000000003e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 1012 aa  328  9e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  36.35 
 
 		 785 aa  327  1e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  32.53 
 
 		 1197 aa  327  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 1098 aa  323  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0519  putative CheA signal transduction histidine kinases  29.62 
 
 		 1029 aa  322  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  35.78 
 
 		 783 aa  320  1e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 1098 aa  320  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.13 
 
 		 1180 aa  320  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 934 aa  320  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  36.71 
 
 		 770 aa  317  9.999999999999999e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 1125 aa  316  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  30.78 
 
 		 741 aa  315  6.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 1137 aa  314  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 1736 aa  310  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  33.39 
 
 		 742 aa  305  5.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 		 977 aa  304  1e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  30.44 
 
 		 783 aa  301  7e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 808 aa  296  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 911 aa  292  4e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 928 aa  291  6e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 974 aa  290  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 740 aa  287  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 679 aa  285  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 760 aa  285  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 		 777 aa  284  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  36.38 
 
 		 679 aa  283  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  29.66 
 
 		 878 aa  282  5e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 		 770 aa  281  7e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  29.26 
 
 		 764 aa  280  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 989 aa  280  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 989 aa  280  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 804 aa  280  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0714  CheA signal transduction histidine kinases  30.78 
 
 		 1020 aa  279  5e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  28.95 
 
 		 734 aa  278  8e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 801 aa  278  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  33.4 
 
 		 789 aa  276  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  30.05 
 
 		 768 aa  275  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  33.14 
 
 		 793 aa  273  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 781 aa  273  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 696 aa  272  5e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  29.32 
 
 		 769 aa  271  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.24 
 
 		 764 aa  271  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 777 aa  271  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  33.27 
 
 		 765 aa  270  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  34.19 
 
 		 801 aa  270  2.9999999999999995e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>