More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4695 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  62.61 
 
 
1098 aa  1222    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  61.01 
 
 
2325 aa  871    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  62.51 
 
 
1098 aa  1218    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  55.27 
 
 
928 aa  717    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  58.28 
 
 
1197 aa  794    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  60.55 
 
 
1155 aa  825    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  59.33 
 
 
1616 aa  800    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1127 aa  2306    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 
977 aa  457  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.44 
 
 
974 aa  443  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
1012 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
1736 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
1065 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 
952 aa  428  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 
1078 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
1137 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
1125 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
974 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.74 
 
 
1180 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0714  CheA signal transduction histidine kinases  35.04 
 
 
1020 aa  352  2e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 
941 aa  352  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
989 aa  351  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
989 aa  349  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  32.93 
 
 
2336 aa  342  2.9999999999999998e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  33.33 
 
 
2458 aa  340  8e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  33.19 
 
 
2476 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  32.79 
 
 
1956 aa  338  5e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  33.64 
 
 
1866 aa  334  4e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 
2423 aa  333  9e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
2539 aa  333  9e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.49 
 
 
1960 aa  332  3e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
1974 aa  332  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  32.38 
 
 
1643 aa  331  5.0000000000000004e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  33.03 
 
 
1987 aa  327  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
2012 aa  326  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
1907 aa  326  1e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  33.8 
 
 
2092 aa  326  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  32.58 
 
 
1992 aa  324  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  31.8 
 
 
2048 aa  323  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.42 
 
 
1971 aa  323  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
2212 aa  320  7.999999999999999e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 
2009 aa  320  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
2414 aa  318  3e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 
1725 aa  317  6e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 
1725 aa  317  7e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 
1832 aa  317  9e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 
1609 aa  315  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  30.78 
 
 
2301 aa  310  8e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  31.94 
 
 
1989 aa  310  8e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  31.38 
 
 
1970 aa  310  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  31.99 
 
 
2301 aa  309  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  31.96 
 
 
1834 aa  304  6.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 
2137 aa  303  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  30.64 
 
 
2070 aa  303  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  34.85 
 
 
770 aa  303  1e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
2164 aa  302  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  32.51 
 
 
2026 aa  301  7e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 
1646 aa  300  8e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 
1646 aa  300  9e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  30.82 
 
 
2284 aa  300  1e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  34.13 
 
 
803 aa  300  1e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
2026 aa  300  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  32.88 
 
 
1983 aa  299  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  33.92 
 
 
770 aa  299  2e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  31.75 
 
 
1888 aa  298  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4348  CheA signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
911 aa  298  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  33.1 
 
 
783 aa  298  4e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4288  CheA signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
911 aa  297  8e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
2022 aa  297  8e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
1629 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  33.09 
 
 
774 aa  295  3e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  32.91 
 
 
769 aa  294  6e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  32.91 
 
 
769 aa  294  6e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  33.09 
 
 
769 aa  293  8e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
1647 aa  293  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
1758 aa  293  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
911 aa  293  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  33.93 
 
 
785 aa  292  2e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
934 aa  292  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.91 
 
 
764 aa  289  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  34.47 
 
 
789 aa  279  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
896 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
896 aa  278  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0519  putative CheA signal transduction histidine kinases  32.28 
 
 
1029 aa  277  8e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
755 aa  274  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 
681 aa  273  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  34.45 
 
 
793 aa  272  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
808 aa  272  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
660 aa  270  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 
760 aa  270  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  29.57 
 
 
878 aa  270  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 
767 aa  268  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
765 aa  267  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0469  CheA signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
830 aa  264  6e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153889  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 
762 aa  264  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0518  CheA signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
2175 aa  262  3e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
777 aa  262  3e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  41.23 
 
 
685 aa  261  6e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 
742 aa  259  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  33.99 
 
 
764 aa  258  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>