More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0616 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 
2137 aa  668    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  79.35 
 
 
2048 aa  2990    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  48.01 
 
 
1907 aa  645    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  35.45 
 
 
1866 aa  829    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  51.96 
 
 
1956 aa  1731    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  40.3 
 
 
1960 aa  741    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  44.5 
 
 
2022 aa  701    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  93.41 
 
 
2012 aa  3513    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  41.36 
 
 
1888 aa  786    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
2009 aa  3967    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  46.24 
 
 
2070 aa  659    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  63.71 
 
 
1989 aa  1221    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 
2026 aa  788    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  42.39 
 
 
2092 aa  677    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  47.78 
 
 
1983 aa  649    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 
2164 aa  725    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  39.09 
 
 
1970 aa  771    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  39.79 
 
 
2026 aa  788    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  44.67 
 
 
2414 aa  634  1e-180  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  39.72 
 
 
1643 aa  634  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 
2212 aa  534  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  33.28 
 
 
2423 aa  530  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
1832 aa  530  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  40.2 
 
 
2301 aa  525  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  45.16 
 
 
1974 aa  522  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.8 
 
 
1971 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
1758 aa  514  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 
1725 aa  512  1e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 
1725 aa  511  1e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  39.43 
 
 
2458 aa  512  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  39.43 
 
 
2476 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0518  CheA signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
2175 aa  500  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  37.47 
 
 
2336 aa  497  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  34.71 
 
 
1992 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  32.22 
 
 
2301 aa  472  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  33.98 
 
 
1987 aa  470  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 
1629 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  32.44 
 
 
2284 aa  453  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 
1609 aa  451  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  39.4 
 
 
2539 aa  452  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 
1646 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 
1647 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 
1646 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  42.37 
 
 
1834 aa  445  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 
1127 aa  324  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 
1065 aa  311  9e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.33 
 
 
2325 aa  306  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 
934 aa  303  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
952 aa  303  2e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  30.4 
 
 
734 aa  301  9e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 
928 aa  298  9e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.17 
 
 
974 aa  297  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 
1736 aa  296  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 
740 aa  295  6e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 
1155 aa  292  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  27.86 
 
 
1180 aa  289  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  30.78 
 
 
1616 aa  288  7e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
741 aa  288  9e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
1125 aa  286  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
742 aa  286  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 
1137 aa  284  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
1078 aa  282  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
1012 aa  281  8e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 
1098 aa  280  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 
1098 aa  280  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
675 aa  280  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 
977 aa  279  3e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
783 aa  273  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 
911 aa  273  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  33.94 
 
 
803 aa  273  2.9999999999999997e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 
974 aa  269  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0519  putative CheA signal transduction histidine kinases  30.11 
 
 
1029 aa  268  5.999999999999999e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
865 aa  268  7e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
865 aa  268  7e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  29.06 
 
 
1197 aa  267  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 
941 aa  267  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 
784 aa  265  6.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 
770 aa  264  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  31.62 
 
 
878 aa  261  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 
781 aa  259  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  32.8 
 
 
769 aa  258  9e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
762 aa  258  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  32.2 
 
 
785 aa  257  2.0000000000000002e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  32.8 
 
 
769 aa  255  5.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  32.6 
 
 
769 aa  254  8.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 
756 aa  254  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0714  CheA signal transduction histidine kinases  28.57 
 
 
1020 aa  254  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  32.72 
 
 
774 aa  253  3e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  32.45 
 
 
770 aa  252  6e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  28.4 
 
 
764 aa  251  7e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 
679 aa  251  9e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  36.48 
 
 
839 aa  251  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4348  CheA signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 
911 aa  249  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 
666 aa  249  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4288  CheA signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 
911 aa  248  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 
679 aa  248  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  31.55 
 
 
783 aa  247  9.999999999999999e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  33.33 
 
 
770 aa  248  9.999999999999999e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 
713 aa  246  3.9999999999999997e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 
760 aa  246  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>