More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3967 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  64.78 
 
 		 2026 aa  789    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  45.35 
 
 		 2048 aa  647    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  57.9 
 
 		 2022 aa  877    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  62.23 
 
 		 2137 aa  743    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  63.15 
 
 		 1888 aa  760    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  65.48 
 
 		 2070 aa  797    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  62.84 
 
 		 2092 aa  971    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 2414 aa  4736    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  65.43 
 
 		 2164 aa  796    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  63.49 
 
 		 1970 aa  779    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  64.38 
 
 		 2026 aa  788    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  62.84 
 
 		 1983 aa  771    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  44.67 
 
 		 2009 aa  625  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  51.6 
 
 		 1866 aa  612  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  51.85 
 
 		 1956 aa  601  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  50.32 
 
 		 1989 aa  596  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  51.29 
 
 		 1907 aa  582  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  50.82 
 
 		 2012 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  49.26 
 
 		 1960 aa  553  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  46.45 
 
 		 1643 aa  546  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  44.43 
 
 		 2336 aa  500  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  42.83 
 
 		 2539 aa  482  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 		 2212 aa  477  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  43.34 
 
 		 2423 aa  473  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  42.17 
 
 		 1971 aa  470  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  43.67 
 
 		 2301 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  42.56 
 
 		 2458 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 		 1974 aa  471  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  42.9 
 
 		 1832 aa  468  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  43.36 
 
 		 1992 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  42.27 
 
 		 2476 aa  467  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 1609 aa  462  9.999999999999999e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  43.21 
 
 		 1987 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 		 1646 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  42.19 
 
 		 1834 aa  454  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 		 1646 aa  450  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  43.17 
 
 		 1725 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 		 1647 aa  450  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  43 
 
 		 1725 aa  446  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  43.14 
 
 		 1629 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 		 1758 aa  442  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  36.88 
 
 		 2301 aa  426  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  32.71 
 
 		 2284 aa  424  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0518  CheA signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 		 2175 aa  407  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.95 
 
 		 2325 aa  324  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 1155 aa  321  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 911 aa  320  3e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 928 aa  320  3e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 1127 aa  318  6e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 952 aa  316  2.9999999999999996e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 740 aa  311  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 934 aa  304  1e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.04 
 
 		 974 aa  299  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 1736 aa  299  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 		 1065 aa  297  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 1098 aa  294  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 1098 aa  291  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 977 aa  290  2e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 1137 aa  290  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 1125 aa  287  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  32.47 
 
 		 1197 aa  281  8e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 1616 aa  281  9e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 1012 aa  281  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 777 aa  279  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 1078 aa  278  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 741 aa  278  7e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 974 aa  277  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  33.39 
 
 		 742 aa  275  9e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 941 aa  275  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  28.74 
 
 		 734 aa  273  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 		 784 aa  273  2.9999999999999997e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.94 
 
 		 1180 aa  271  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0714  CheA signal transduction histidine kinases  28.06 
 
 		 1020 aa  263  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  30.44 
 
 		 804 aa  261  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 777 aa  258  9e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  34.22 
 
 		 785 aa  253  2e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 989 aa  253  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 989 aa  253  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 679 aa  252  6e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 679 aa  252  7e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  32.99 
 
 		 878 aa  250  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 783 aa  249  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  34.3 
 
 		 798 aa  249  4.9999999999999997e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  30.76 
 
 		 774 aa  249  6e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 772 aa  249  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 762 aa  248  9e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  36.92 
 
 		 839 aa  248  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  33.2 
 
 		 770 aa  246  3e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 760 aa  246  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  33.47 
 
 		 769 aa  246  3.9999999999999997e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  33.81 
 
 		 783 aa  246  3.9999999999999997e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  33.68 
 
 		 769 aa  246  3.9999999999999997e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  33.47 
 
 		 769 aa  245  6e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  33.68 
 
 		 770 aa  244  1e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 801 aa  244  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  32.03 
 
 		 832 aa  242  6.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  26.22 
 
 		 803 aa  239  3e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  32.74 
 
 		 752 aa  239  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.86 
 
 		 864 aa  238  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.86 
 
 		 864 aa  238  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>