More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0518 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0518  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
2175 aa  4356    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 
2212 aa  565  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
1725 aa  563  1e-158  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  39.45 
 
 
2301 aa  555  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  33.36 
 
 
1725 aa  556  1e-156  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 
1974 aa  553  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  37.16 
 
 
1834 aa  553  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  39.75 
 
 
2539 aa  551  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 
2423 aa  550  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  36.17 
 
 
2458 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  38.95 
 
 
1992 aa  545  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  39.25 
 
 
2476 aa  540  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  38 
 
 
1987 aa  535  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 
1832 aa  535  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.47 
 
 
1971 aa  533  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  39.03 
 
 
2336 aa  533  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
2009 aa  514  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 
1629 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
1758 aa  512  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
2012 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
1646 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 
1646 aa  506  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 
1647 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.27 
 
 
1960 aa  496  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  30.58 
 
 
1956 aa  493  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  35.08 
 
 
1888 aa  491  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  34.62 
 
 
2048 aa  480  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
2164 aa  480  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  36.65 
 
 
2026 aa  478  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  38.2 
 
 
2092 aa  476  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
2026 aa  475  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  32.43 
 
 
2284 aa  474  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  32.88 
 
 
2301 aa  471  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  37.11 
 
 
1983 aa  461  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  35.82 
 
 
1970 aa  462  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
1609 aa  460  1e-127  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  35.24 
 
 
1989 aa  452  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 
2414 aa  453  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  34.72 
 
 
2070 aa  447  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
2022 aa  447  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  37.94 
 
 
1643 aa  440  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  40.85 
 
 
1866 aa  432  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 
2137 aa  432  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 
1907 aa  433  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
934 aa  317  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
911 aa  285  5.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  29.9 
 
 
769 aa  285  7.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  29.59 
 
 
774 aa  281  1e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  34.73 
 
 
770 aa  281  1e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.29 
 
 
2325 aa  279  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
742 aa  275  6e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  34.82 
 
 
785 aa  275  1e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 
1125 aa  273  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  34.32 
 
 
783 aa  273  4e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
1127 aa  272  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 
1137 aa  271  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
1065 aa  270  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  34.37 
 
 
769 aa  267  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  35.24 
 
 
770 aa  267  2e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  33.95 
 
 
769 aa  265  4.999999999999999e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.66 
 
 
974 aa  265  6.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.3 
 
 
764 aa  264  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 
952 aa  263  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 
1078 aa  261  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0519  putative CheA signal transduction histidine kinases  26.51 
 
 
1029 aa  261  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  33.76 
 
 
803 aa  261  2e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  29.94 
 
 
789 aa  259  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 
679 aa  259  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 
1155 aa  259  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  28.53 
 
 
1180 aa  259  5e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  28.57 
 
 
734 aa  258  6e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
1098 aa  258  8e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  31.6 
 
 
878 aa  258  8e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  29.7 
 
 
764 aa  258  9e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
741 aa  257  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
1098 aa  257  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
1616 aa  257  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
755 aa  256  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  35.24 
 
 
839 aa  251  9e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
679 aa  251  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  27.74 
 
 
768 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 
783 aa  247  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 
1736 aa  246  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  28.68 
 
 
769 aa  245  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  28.59 
 
 
1012 aa  244  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 
765 aa  243  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  32.39 
 
 
793 aa  242  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
928 aa  242  5e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 
760 aa  242  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 
762 aa  241  9e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  28.74 
 
 
1197 aa  240  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
767 aa  240  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
941 aa  238  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0469  CheA signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
830 aa  238  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153889  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  28.35 
 
 
798 aa  238  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 
686 aa  238  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  28.93 
 
 
763 aa  236  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
740 aa  236  5e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  29.54 
 
 
752 aa  235  7.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  31.58 
 
 
801 aa  235  8.000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>