More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0126 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 		 1974 aa  716    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 1646 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  38.6 
 
 		 1987 aa  710    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  39.82 
 
 		 1992 aa  736    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  44.88 
 
 		 2212 aa  645    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1758 aa  3573    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.74 
 
 		 1971 aa  709    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 1629 aa  640    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 		 2423 aa  728    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 1646 aa  642    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  29.58 
 
 		 1643 aa  655    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  39.61 
 
 		 2301 aa  651    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  38.61 
 
 		 2476 aa  717    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  38.36 
 
 		 2458 aa  737    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 1832 aa  791    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  39.12 
 
 		 2539 aa  707    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 1647 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  38.29 
 
 		 2284 aa  633  1e-180  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  44.37 
 
 		 2301 aa  633  1e-179  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  42.17 
 
 		 2336 aa  622  1e-176  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  42.14 
 
 		 1725 aa  584  1.0000000000000001e-165  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 		 1725 aa  582  1e-164  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  49 
 
 		 1834 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.21 
 
 		 1960 aa  555  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  36.57 
 
 		 1866 aa  528  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 1609 aa  526  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 2012 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 2009 aa  513  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  38 
 
 		 1989 aa  508  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  38.4 
 
 		 2048 aa  504  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  36.57 
 
 		 1956 aa  502  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  36.56 
 
 		 2092 aa  489  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  36.61 
 
 		 1970 aa  472  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0518  CheA signal transduction histidine kinase  33.37 
 
 		 2175 aa  467  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  35.24 
 
 		 2026 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 		 2026 aa  466  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  35.88 
 
 		 1888 aa  465  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 2164 aa  463  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 2137 aa  450  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  36.12 
 
 		 1983 aa  447  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  38.2 
 
 		 2070 aa  447  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 		 2414 aa  441  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 2022 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.95 
 
 		 2325 aa  330  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0519  putative CheA signal transduction histidine kinases  29.62 
 
 		 1029 aa  322  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  36.84 
 
 		 770 aa  321  7.999999999999999e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  38.32 
 
 		 785 aa  320  1e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  38.78 
 
 		 769 aa  320  2e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  38.57 
 
 		 769 aa  318  4e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  38.57 
 
 		 769 aa  319  4e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  38.22 
 
 		 803 aa  318  8e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 1065 aa  316  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  37.89 
 
 		 783 aa  314  7.999999999999999e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 934 aa  312  2.9999999999999997e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 1616 aa  310  2.0000000000000002e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  38.51 
 
 		 770 aa  308  5.0000000000000004e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  35.3 
 
 		 1155 aa  308  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 1012 aa  303  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  37.61 
 
 		 774 aa  302  3e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  29.73 
 
 		 734 aa  302  4e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 1078 aa  298  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 952 aa  298  9e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 1125 aa  297  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 1137 aa  295  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.44 
 
 		 1180 aa  295  6e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 1127 aa  293  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 679 aa  291  6e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 740 aa  290  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 1098 aa  289  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 		 977 aa  288  5.999999999999999e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 679 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 742 aa  286  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 1736 aa  286  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 1098 aa  285  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  30.57 
 
 		 1197 aa  285  4.0000000000000003e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 974 aa  284  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 783 aa  283  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 741 aa  282  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 989 aa  281  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 989 aa  281  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 784 aa  280  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 928 aa  278  9e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 911 aa  272  4e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  27.81 
 
 		 764 aa  272  4e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  34.24 
 
 		 878 aa  272  5e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  33.77 
 
 		 768 aa  271  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 686 aa  269  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 777 aa  269  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 781 aa  269  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 660 aa  269  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 755 aa  268  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 		 760 aa  267  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 756 aa  266  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4348  CheA signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 911 aa  265  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  28 
 
 		 764 aa  265  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4288  CheA signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 911 aa  264  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  34.63 
 
 		 763 aa  262  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  31.76 
 
 		 769 aa  261  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  29.22 
 
 		 670 aa  259  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.58 
 
 		 764 aa  259  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>