More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0859 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  46.8 
 
 		 1012 aa  852    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  43.91 
 
 		 977 aa  771    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  48.12 
 
 		 974 aa  840    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 952 aa  1929    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  56.12 
 
 		 1065 aa  734    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  41.42 
 
 		 974 aa  708    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.92 
 
 		 2325 aa  442  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 1127 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 989 aa  432  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 989 aa  432  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 1736 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 1155 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 941 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 		 1078 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 1616 aa  415  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 1098 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 1098 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 1125 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 1137 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  35.38 
 
 		 1197 aa  396  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.44 
 
 		 1180 aa  389  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4348  CheA signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 911 aa  363  6e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4288  CheA signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 911 aa  363  8e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0714  CheA signal transduction histidine kinases  31.3 
 
 		 1020 aa  352  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 1974 aa  339  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 2423 aa  331  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1907 aa  324  4e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 2414 aa  321  3.9999999999999996e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.16 
 
 		 1971 aa  320  7e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  27.29 
 
 		 2301 aa  318  3e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  32.06 
 
 		 2048 aa  318  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  30.66 
 
 		 1956 aa  317  7e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  31.9 
 
 		 2336 aa  317  9.999999999999999e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 2539 aa  316  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 742 aa  315  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  32.03 
 
 		 2476 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  32.13 
 
 		 1834 aa  313  9e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  31.36 
 
 		 1989 aa  313  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  31.98 
 
 		 2458 aa  311  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  31.2 
 
 		 1866 aa  310  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 741 aa  309  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 1609 aa  308  3e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 2012 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  31.44 
 
 		 2092 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 1646 aa  304  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 1646 aa  303  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  30.9 
 
 		 1643 aa  303  1e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 2009 aa  302  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  27.37 
 
 		 1992 aa  301  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 1758 aa  300  7e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  33.54 
 
 		 785 aa  300  8e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  27.08 
 
 		 1987 aa  300  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  33.27 
 
 		 803 aa  300  1e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 1629 aa  299  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 1647 aa  299  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 911 aa  297  6e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  26.37 
 
 		 2284 aa  295  2e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  33.53 
 
 		 770 aa  296  2e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 934 aa  294  6e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.05 
 
 		 1960 aa  293  7e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  28.55 
 
 		 2026 aa  292  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  28.9 
 
 		 1983 aa  293  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 1832 aa  292  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 2212 aa  293  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  32.67 
 
 		 774 aa  292  3e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 2026 aa  291  5.0000000000000004e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  32.14 
 
 		 783 aa  291  5.0000000000000004e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  31.54 
 
 		 770 aa  290  7e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 		 2022 aa  288  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  30.53 
 
 		 769 aa  288  2.9999999999999996e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  30.53 
 
 		 769 aa  288  5e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  31.53 
 
 		 769 aa  287  5e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  28.53 
 
 		 1970 aa  286  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  30.18 
 
 		 2301 aa  285  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  30.32 
 
 		 2070 aa  283  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 		 740 aa  283  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 2137 aa  282  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 770 aa  280  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0519  putative CheA signal transduction histidine kinases  30.03 
 
 		 1029 aa  278  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 808 aa  277  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 865 aa  275  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 865 aa  275  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 1725 aa  273  1e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 756 aa  270  8.999999999999999e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  26.31 
 
 		 896 aa  270  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 		 2164 aa  270  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 1725 aa  269  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  29.86 
 
 		 734 aa  267  8e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  33.97 
 
 		 793 aa  266  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  33.96 
 
 		 789 aa  266  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 705 aa  263  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  28.82 
 
 		 1888 aa  262  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 896 aa  260  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 784 aa  258  4e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 705 aa  257  7e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 603 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.76 
 
 		 764 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0518  CheA signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 		 2175 aa  255  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  32.21 
 
 		 864 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 		 666 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>