More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0907 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
911 aa  1805    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  48.99 
 
 
934 aa  817    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
742 aa  342  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
2212 aa  336  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
741 aa  335  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  32.19 
 
 
2301 aa  335  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.11 
 
 
1971 aa  335  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  31.57 
 
 
1987 aa  327  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
2539 aa  327  5e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
2414 aa  323  6e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  32.13 
 
 
1643 aa  323  9.999999999999999e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  30.83 
 
 
1992 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
2164 aa  318  3e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  29.13 
 
 
2301 aa  318  4e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  31 
 
 
1725 aa  317  7e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 
1725 aa  314  3.9999999999999997e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  30.26 
 
 
1970 aa  313  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  33.85 
 
 
2070 aa  311  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  28.29 
 
 
2284 aa  311  4e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
1832 aa  310  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  30.97 
 
 
1956 aa  309  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  31.55 
 
 
1888 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  33.28 
 
 
941 aa  304  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
1646 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
1646 aa  303  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  29.41 
 
 
734 aa  303  9e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  31.06 
 
 
1989 aa  302  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
1125 aa  300  7e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 
1127 aa  300  8e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
1137 aa  300  9e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
2026 aa  299  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
1736 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  29.26 
 
 
2336 aa  299  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  31.42 
 
 
2458 aa  299  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  30.42 
 
 
2026 aa  299  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  31.04 
 
 
2137 aa  298  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
1629 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
1647 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  33.74 
 
 
1834 aa  295  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.82 
 
 
1960 aa  295  3e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  31.88 
 
 
1866 aa  294  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
1065 aa  294  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
1907 aa  293  7e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
1974 aa  293  8e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.39 
 
 
1098 aa  292  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  28 
 
 
785 aa  292  2e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
1616 aa  291  3e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  30.6 
 
 
1983 aa  291  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 
952 aa  290  8e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0518  CheA signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
2175 aa  289  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
1155 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
1609 aa  288  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 
2423 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
1098 aa  288  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  31.35 
 
 
2048 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  34 
 
 
2022 aa  286  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.56 
 
 
2325 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
740 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
762 aa  284  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  27.83 
 
 
774 aa  283  1e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  27.58 
 
 
770 aa  282  2e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 
1758 aa  281  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  31.03 
 
 
1197 aa  280  6e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  32.28 
 
 
2476 aa  280  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 
1078 aa  280  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
2012 aa  278  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  28.64 
 
 
798 aa  278  5e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 
1012 aa  277  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  27 
 
 
769 aa  276  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.75 
 
 
974 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.24 
 
 
1180 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  26.99 
 
 
769 aa  275  3e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 
781 aa  275  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 
2009 aa  273  7e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
928 aa  273  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
977 aa  273  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  26.48 
 
 
783 aa  273  1e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  26.73 
 
 
769 aa  272  2e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  28.99 
 
 
764 aa  272  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 
865 aa  272  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 
865 aa  271  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
974 aa  270  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4288  CheA signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 
911 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
679 aa  268  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4348  CheA signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 
911 aa  269  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
783 aa  269  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0714  CheA signal transduction histidine kinases  28.75 
 
 
1020 aa  267  7e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  28.68 
 
 
789 aa  265  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 
755 aa  263  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  28.1 
 
 
768 aa  263  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 
989 aa  261  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 
989 aa  261  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.04 
 
 
764 aa  259  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  28.37 
 
 
769 aa  258  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 
756 aa  258  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  28.99 
 
 
763 aa  257  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 
765 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
762 aa  254  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  33.54 
 
 
839 aa  254  7e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0469  CheA signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 
830 aa  253  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153889  normal  0.631146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>