More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1492 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  52.63 
 
 		 769 aa  706    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  95.7 
 
 		 767 aa  1355    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 762 aa  1499    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  69.86 
 
 		 793 aa  1055    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  69.96 
 
 		 789 aa  1063    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  55.9 
 
 		 763 aa  786    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  52.44 
 
 		 804 aa  730    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  76.17 
 
 		 764 aa  1113    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  52.84 
 
 		 769 aa  702    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  86.22 
 
 		 755 aa  1254    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  57.95 
 
 		 768 aa  850    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  52.63 
 
 		 769 aa  706    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  52.33 
 
 		 760 aa  729    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  98.56 
 
 		 765 aa  1400    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  51.99 
 
 		 769 aa  693    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  51.48 
 
 		 769 aa  692    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  69.05 
 
 		 769 aa  990    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  52.63 
 
 		 769 aa  706    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  69.08 
 
 		 764 aa  997    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  54.13 
 
 		 766 aa  720    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 		 808 aa  626  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  53.08 
 
 		 832 aa  615  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  52.42 
 
 		 864 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  52.42 
 
 		 864 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  52.27 
 
 		 864 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  52.27 
 
 		 864 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  52.27 
 
 		 864 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  52.27 
 
 		 864 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  56.15 
 
 		 1079 aa  611  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  44.81 
 
 		 752 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  49.05 
 
 		 896 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  49.05 
 
 		 896 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  33.29 
 
 		 742 aa  366  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  32.08 
 
 		 734 aa  358  1.9999999999999998e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 679 aa  348  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 741 aa  348  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 679 aa  346  8.999999999999999e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 2539 aa  332  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 740 aa  331  3e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 762 aa  329  9e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 772 aa  327  4.0000000000000003e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  39.45 
 
 		 878 aa  325  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  29.99 
 
 		 784 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  29.74 
 
 		 764 aa  313  6.999999999999999e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  30.01 
 
 		 769 aa  312  1e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  30.17 
 
 		 769 aa  312  1e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 2423 aa  310  8e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  29.97 
 
 		 769 aa  309  1.0000000000000001e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.19 
 
 		 1971 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 686 aa  308  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  31.15 
 
 		 1992 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  29.42 
 
 		 2336 aa  305  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 783 aa  302  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  37.02 
 
 		 2458 aa  301  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 801 aa  300  5e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  29.61 
 
 		 774 aa  299  1e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  36.48 
 
 		 2476 aa  299  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 1646 aa  296  9e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 1646 aa  296  9e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  29.86 
 
 		 2301 aa  295  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 2212 aa  294  5e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  29.26 
 
 		 1987 aa  291  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 1629 aa  289  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 1647 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 781 aa  286  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  28.55 
 
 		 865 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  28.55 
 
 		 865 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 705 aa  285  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 777 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 		 777 aa  281  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  34.3 
 
 		 770 aa  281  3e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  35.76 
 
 		 770 aa  280  7e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  28.09 
 
 		 2301 aa  278  2e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 		 756 aa  278  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  28.38 
 
 		 798 aa  278  3e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 1725 aa  277  5e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 		 1725 aa  276  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  27.28 
 
 		 1609 aa  276  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  29.6 
 
 		 1956 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 777 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 		 705 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 1758 aa  273  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  33.47 
 
 		 783 aa  271  4e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 974 aa  270  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 1155 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0657  CheA signal transduction histidine kinase  30.01 
 
 		 758 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0137797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  33.4 
 
 		 785 aa  269  1e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  30.84 
 
 		 601 aa  269  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 607 aa  269  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  27.65 
 
 		 2284 aa  268  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  30.19 
 
 		 2048 aa  268  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.27 
 
 		 1974 aa  266  8e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  32.61 
 
 		 839 aa  266  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5118  CheA signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 707 aa  265  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179318  normal  0.034812 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 1907 aa  265  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  29.04 
 
 		 764 aa  265  3e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0600  CheA signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 706 aa  264  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  30.76 
 
 		 598 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 1127 aa  263  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 695 aa  263  8e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>