More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1329 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
777 aa  1556    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 
772 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  45.15 
 
 
777 aa  549  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  41.21 
 
 
784 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  38.88 
 
 
764 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  38.19 
 
 
764 aa  478  1e-133  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
801 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  34.07 
 
 
798 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  46.55 
 
 
777 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
781 aa  378  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
741 aa  368  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
742 aa  369  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
783 aa  355  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
695 aa  353  5e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
756 aa  353  5e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  30.93 
 
 
734 aa  350  5e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
762 aa  347  5e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
679 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
740 aa  341  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
679 aa  340  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 
705 aa  328  3e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 
705 aa  323  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 
686 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  32.02 
 
 
752 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1193  CheA signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 
706 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0440291  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 
808 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  31.26 
 
 
760 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  30.46 
 
 
768 aa  308  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
766 aa  307  6e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 
769 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  31.65 
 
 
763 aa  300  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 
865 aa  300  9e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 
865 aa  300  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
896 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
769 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
896 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  31.17 
 
 
769 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  31.17 
 
 
769 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0469  CheA signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
830 aa  298  4e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153889  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  28.75 
 
 
774 aa  297  6e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  35.92 
 
 
878 aa  296  7e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
755 aa  294  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  30.96 
 
 
764 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.15 
 
 
764 aa  289  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3533  CheA signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 
808 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.229129  normal  0.100521 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  35.27 
 
 
769 aa  287  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  34.56 
 
 
832 aa  286  7e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  34.75 
 
 
864 aa  286  8e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  34.75 
 
 
864 aa  286  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
769 aa  286  9e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  34.75 
 
 
864 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  34.75 
 
 
864 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  34.75 
 
 
864 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  34.75 
 
 
864 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  34.56 
 
 
1079 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
767 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3253  CheA signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
756 aa  284  5.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0312912  normal  0.0661628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
765 aa  283  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
762 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 
1907 aa  282  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  35.26 
 
 
769 aa  278  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  34.95 
 
 
770 aa  278  4e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  32.98 
 
 
803 aa  276  7e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  33.63 
 
 
770 aa  274  4.0000000000000004e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  33.19 
 
 
785 aa  274  4.0000000000000004e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  33.41 
 
 
783 aa  274  5.000000000000001e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  33.48 
 
 
769 aa  273  7e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0638  CheA signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 
753 aa  273  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  33.26 
 
 
769 aa  272  1e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  28.05 
 
 
789 aa  273  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0647  CheA signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 
756 aa  273  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0657  CheA signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 
758 aa  273  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0137797  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  33.26 
 
 
769 aa  273  1e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  34.04 
 
 
793 aa  272  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0613  CheA signal transduction histidine kinase  30.76 
 
 
750 aa  272  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.972381  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
804 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0600  CheA signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 
706 aa  270  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  34.19 
 
 
2092 aa  264  4e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
1098 aa  264  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 
1155 aa  263  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  28.28 
 
 
1992 aa  263  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
1974 aa  263  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  31.84 
 
 
1866 aa  262  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  26.84 
 
 
1971 aa  262  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
1127 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
1098 aa  259  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 
2414 aa  258  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 
1125 aa  257  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.47 
 
 
2325 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 
1137 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  30.24 
 
 
2070 aa  254  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3136  CheA signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 
649 aa  254  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382319  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  27.88 
 
 
2026 aa  254  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  35.49 
 
 
839 aa  254  4.0000000000000004e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 
1646 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 
1646 aa  254  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
2212 aa  253  7e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 
2026 aa  253  7e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  27.62 
 
 
1970 aa  253  9.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 
2539 aa  253  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>