More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3791 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  53.14 
 
 
762 aa  713    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  93.5 
 
 
769 aa  1328    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  59.15 
 
 
804 aa  841    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  52.28 
 
 
793 aa  727    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  53.27 
 
 
765 aa  711    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  79.81 
 
 
864 aa  964    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  52.32 
 
 
789 aa  733    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  79.97 
 
 
864 aa  965    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  54.26 
 
 
763 aa  750    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  83.85 
 
 
1079 aa  958    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  53.51 
 
 
764 aa  716    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  97.27 
 
 
769 aa  1414    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  52.2 
 
 
764 aa  713    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  52.72 
 
 
767 aa  709    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  81.34 
 
 
832 aa  968    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  99.87 
 
 
769 aa  1507    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  91.3 
 
 
766 aa  1342    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  43.07 
 
 
808 aa  640    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  79.97 
 
 
864 aa  965    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  53.02 
 
 
768 aa  747    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  52.29 
 
 
755 aa  709    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 
769 aa  1508    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  79.81 
 
 
864 aa  964    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  79.81 
 
 
864 aa  964    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  93.76 
 
 
769 aa  1337    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  52.2 
 
 
769 aa  716    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 
769 aa  1508    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  79.81 
 
 
864 aa  964    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  65.89 
 
 
760 aa  926    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  45.82 
 
 
752 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  47.93 
 
 
896 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  47.76 
 
 
896 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
742 aa  357  5.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  34.37 
 
 
762 aa  341  2.9999999999999998e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  32.65 
 
 
734 aa  337  3.9999999999999995e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
741 aa  337  7e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
679 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  36.91 
 
 
878 aa  318  3e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
740 aa  316  9e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
686 aa  312  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 
679 aa  311  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
777 aa  308  3e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 
772 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
784 aa  303  6.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 
781 aa  300  9e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  29.24 
 
 
769 aa  297  6e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  29.11 
 
 
769 aa  296  1e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  28.98 
 
 
769 aa  295  2e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  30.03 
 
 
764 aa  293  7e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  35.12 
 
 
839 aa  287  4e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.66 
 
 
1971 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
783 aa  285  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 
705 aa  284  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  28.95 
 
 
1992 aa  281  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 
695 aa  280  1e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  29.24 
 
 
1987 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  26.66 
 
 
1609 aa  279  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 
598 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 
2539 aa  278  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 
705 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  30.45 
 
 
764 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  33.85 
 
 
2458 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  33.59 
 
 
2476 aa  273  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  33.33 
 
 
770 aa  271  2.9999999999999997e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  29.78 
 
 
2301 aa  271  4e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
2212 aa  271  4e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  27.62 
 
 
2336 aa  270  5e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 
865 aa  270  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 
865 aa  270  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  26.91 
 
 
2301 aa  268  2e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 
604 aa  268  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  27.35 
 
 
774 aa  268  4e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  30.79 
 
 
601 aa  267  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 
2423 aa  266  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
1065 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0657  CheA signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 
758 aa  265  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0137797  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
756 aa  263  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  33.04 
 
 
785 aa  262  2e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  33.77 
 
 
770 aa  261  4e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
603 aa  261  5.0000000000000005e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0613  CheA signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
750 aa  261  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.972381  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  27.21 
 
 
798 aa  261  5.0000000000000005e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  33.04 
 
 
783 aa  260  6e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0647  CheA signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
756 aa  260  8e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
952 aa  259  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1193  CheA signal transduction histidine kinase  40.04 
 
 
706 aa  259  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0440291  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
974 aa  259  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0638  CheA signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
753 aa  259  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 
1974 aa  257  6e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 
1127 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
607 aa  256  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
777 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  32.97 
 
 
803 aa  254  6e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 
801 aa  253  7e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
1646 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
1646 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 
1629 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.29 
 
 
1960 aa  253  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  30.44 
 
 
1834 aa  252  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
1725 aa  251  4e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>