More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2839 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2839  response regulator receiver  100 
 
 		 748 aa  1430    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2957  CheA signal transduction histidine kinase  87.6 
 
 		 758 aa  1169    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3065  CheA signal transduction histidine kinase  97.99 
 
 		 748 aa  1360    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.93771  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5453  CheA signal transduction histidine kinase  53.58 
 
 		 747 aa  592  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0244  CheA signal transduction histidine kinase  52.52 
 
 		 747 aa  559  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2186  CheA signal transduction histidine kinase  55.32 
 
 		 768 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3078  CheA signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 		 719 aa  390  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00446051 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 741 aa  303  6.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  32.04 
 
 		 734 aa  297  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 742 aa  295  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 772 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 679 aa  271  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 781 aa  269  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  30.37 
 
 		 764 aa  264  4e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  30.46 
 
 		 764 aa  258  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 784 aa  258  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 679 aa  256  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 740 aa  256  8e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 686 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  34.7 
 
 		 763 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 762 aa  253  8.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 777 aa  253  9.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 756 aa  253  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  35.56 
 
 		 839 aa  251  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 801 aa  250  6e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 783 aa  246  8e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  35.45 
 
 		 878 aa  245  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  28.15 
 
 		 798 aa  242  1e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  32.62 
 
 		 764 aa  242  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0600  CheA signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 706 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 		 705 aa  240  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 777 aa  239  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  40.41 
 
 		 705 aa  238  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3253  CheA signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 756 aa  237  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0312912  normal  0.0661628 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.51 
 
 		 764 aa  237  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 934 aa  235  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  30.07 
 
 		 1866 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 777 aa  233  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 695 aa  233  1e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  29.82 
 
 		 2301 aa  232  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  31.29 
 
 		 769 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2367  CheA signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 688 aa  230  6e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.990508  decreased coverage  0.0000928264 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 755 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  30.62 
 
 		 768 aa  229  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  29.91 
 
 		 1956 aa  228  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 2539 aa  225  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 2212 aa  224  4e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 1907 aa  223  7e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  29.56 
 
 		 789 aa  223  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  29.83 
 
 		 1989 aa  223  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 865 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 766 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 865 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.74 
 
 		 1180 aa  221  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3136  CheA signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 649 aa  220  7e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5118  CheA signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 707 aa  220  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179318  normal  0.034812 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 1012 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4348  CheA signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 911 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 989 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 989 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4288  CheA signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 911 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 762 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 896 aa  217  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0469  CheA signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 		 830 aa  217  7e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153889  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 896 aa  217  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 767 aa  217  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  28.16 
 
 		 1992 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 765 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 941 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 1125 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 1137 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 952 aa  214  4.9999999999999996e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 911 aa  213  7e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  28.34 
 
 		 1971 aa  214  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  28.97 
 
 		 2048 aa  213  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  32.97 
 
 		 1970 aa  211  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  27.67 
 
 		 1987 aa  210  8e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 769 aa  210  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  23.99 
 
 		 769 aa  209  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  29.83 
 
 		 769 aa  209  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  29.83 
 
 		 769 aa  209  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  23.99 
 
 		 769 aa  209  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 2012 aa  207  7e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 760 aa  207  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 769 aa  206  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 1127 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  29.4 
 
 		 2336 aa  206  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 2164 aa  206  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  24.25 
 
 		 769 aa  205  2e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  28.52 
 
 		 974 aa  206  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  30.66 
 
 		 832 aa  206  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 1629 aa  205  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 2414 aa  204  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 2009 aa  204  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  30.15 
 
 		 1983 aa  204  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  31 
 
 		 864 aa  203  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3533  CheA signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 808 aa  203  9e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.229129  normal  0.100521 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  32.77 
 
 		 1643 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  31 
 
 		 864 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 1974 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>