More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3065 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2839  response regulator receiver  97.99 
 
 		 748 aa  1353    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2957  CheA signal transduction histidine kinase  86.94 
 
 		 758 aa  1164    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3065  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 748 aa  1427    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.93771  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5453  CheA signal transduction histidine kinase  53.32 
 
 		 747 aa  593  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0244  CheA signal transduction histidine kinase  51.8 
 
 		 747 aa  555  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2186  CheA signal transduction histidine kinase  55.56 
 
 		 768 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3078  CheA signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 		 719 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00446051 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 741 aa  307  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 742 aa  296  7e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  32.7 
 
 		 734 aa  293  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 679 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 772 aa  269  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 781 aa  266  8.999999999999999e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  30.42 
 
 		 764 aa  265  3e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 679 aa  263  8e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 740 aa  261  5.0000000000000005e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 686 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 784 aa  255  3e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 762 aa  253  7e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  30.07 
 
 		 764 aa  251  3e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 777 aa  250  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  38.22 
 
 		 839 aa  250  5e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 756 aa  249  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  33.99 
 
 		 763 aa  249  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  35.66 
 
 		 878 aa  246  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 783 aa  244  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 		 705 aa  243  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 777 aa  242  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3253  CheA signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 756 aa  241  5e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0312912  normal  0.0661628 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0600  CheA signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 706 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  32.1 
 
 		 764 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 934 aa  234  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 695 aa  233  1e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2367  CheA signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 		 688 aa  232  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.990508  decreased coverage  0.0000928264 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 777 aa  230  9e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  29.89 
 
 		 1866 aa  229  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  30.49 
 
 		 768 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  32.74 
 
 		 769 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.03 
 
 		 764 aa  228  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 755 aa  228  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 801 aa  226  9e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 1907 aa  226  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  32.85 
 
 		 798 aa  226  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  29.83 
 
 		 1956 aa  224  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 865 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 865 aa  224  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  29.71 
 
 		 1989 aa  224  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 		 2212 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 1012 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5118  CheA signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 707 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179318  normal  0.034812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 989 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 989 aa  221  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 766 aa  221  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 2539 aa  221  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3136  CheA signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 649 aa  220  6e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4348  CheA signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 911 aa  220  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4288  CheA signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 911 aa  220  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.54 
 
 		 1180 aa  220  7.999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  33.61 
 
 		 789 aa  219  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 941 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  32.57 
 
 		 2301 aa  219  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 1125 aa  218  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 896 aa  218  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 896 aa  217  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 1137 aa  217  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 767 aa  217  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0469  CheA signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 830 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153889  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 762 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  27.59 
 
 		 1992 aa  213  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 952 aa  213  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 765 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 911 aa  212  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  27.73 
 
 		 1971 aa  211  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  32.97 
 
 		 1970 aa  211  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  28.57 
 
 		 2048 aa  209  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 1127 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 760 aa  208  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  24.12 
 
 		 769 aa  208  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 769 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  23.99 
 
 		 769 aa  207  7e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  26.66 
 
 		 1987 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  29.73 
 
 		 769 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  29.73 
 
 		 769 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  28.19 
 
 		 974 aa  205  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  31.19 
 
 		 832 aa  205  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  27.33 
 
 		 2336 aa  206  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 2164 aa  205  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  32.77 
 
 		 1643 aa  205  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 769 aa  204  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  24.29 
 
 		 769 aa  204  5e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3533  CheA signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 808 aa  204  5e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.229129  normal  0.100521 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  30.15 
 
 		 1983 aa  204  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  30.7 
 
 		 864 aa  203  8e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  30.7 
 
 		 864 aa  203  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 2009 aa  203  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 1629 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 1098 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 2414 aa  202  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 1974 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 2012 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>