More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2795 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  100 
 
 		 121 aa  249  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  72.03 
 
 		 120 aa  182  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  64.41 
 
 		 120 aa  173  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  63.48 
 
 		 125 aa  166  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  51.69 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  50 
 
 		 121 aa  138  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  50 
 
 		 121 aa  138  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  52.54 
 
 		 120 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  50 
 
 		 121 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  49.15 
 
 		 121 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  47.9 
 
 		 124 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  48.31 
 
 		 121 aa  126  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  48.31 
 
 		 121 aa  126  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 119 aa  123  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  47.41 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  47.41 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  42.02 
 
 		 120 aa  120  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  43.33 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 120 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 234 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1422  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.153955  normal  0.123704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 245 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  46.22 
 
 		 121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  41.67 
 
 		 128 aa  113  8.999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  41.18 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  43.44 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 229 aa  110  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  48.15 
 
 		 121 aa  110  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  42.15 
 
 		 121 aa  110  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 121 aa  110  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 123 aa  110  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  47.22 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  47.22 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  47.22 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  47.22 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  43.12 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 236 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 227 aa  109  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  42.24 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  41.74 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  40.52 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.98 
 
 		 310 aa  107  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 229 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 121 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  42.45 
 
 		 125 aa  105  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 230 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  43.75 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4345  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 122 aa  105  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4285  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 122 aa  105  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  42.24 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 120 aa  105  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  42.61 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  41.8 
 
 		 122 aa  103  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  41.53 
 
 		 120 aa  103  7e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 576 aa  103  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  39.5 
 
 		 460 aa  103  8e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 229 aa  103  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 231 aa  103  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 227 aa  102  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 		 234 aa  102  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  38.98 
 
 		 236 aa  102  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 236 aa  101  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 225 aa  100  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.66 
 
 		 236 aa  100  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3109  response regulator receiver  43.48 
 
 		 285 aa  100  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0893452  normal  0.677049 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 231 aa  100  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 231 aa  100  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 		 233 aa  100  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.32 
 
 		 235 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  40 
 
 		 216 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  36.52 
 
 		 227 aa  100  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 121 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 123 aa  100  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 232 aa  100  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  38.14 
 
 		 225 aa  99.8  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 236 aa  99.8  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1257  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 230 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.621627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 		 230 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.26 
 
 		 225 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 		 1907 aa  99.8  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2599  phosphate regulon transcriptional regulator, PhoR  39.13 
 
 		 230 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 226 aa  99.8  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 		 230 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  38.98 
 
 		 230 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>