More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2789 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  100 
 
 		 121 aa  246  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  72.73 
 
 		 121 aa  184  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  72.73 
 
 		 121 aa  184  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  54.17 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  54.17 
 
 		 121 aa  144  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  56.3 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  56.78 
 
 		 120 aa  141  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 121 aa  140  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1422  response regulator receiver protein  54.62 
 
 		 119 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.153955  normal  0.123704 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  50 
 
 		 124 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  49.15 
 
 		 121 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  49.59 
 
 		 125 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  49.15 
 
 		 120 aa  130  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  45.83 
 
 		 121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  48.74 
 
 		 125 aa  128  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 120 aa  126  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  45 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  45 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  50.42 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  50.42 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  50 
 
 		 121 aa  120  9e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  44.64 
 
 		 121 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  43.33 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  47.57 
 
 		 121 aa  114  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  46.6 
 
 		 121 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 146 aa  113  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  46.6 
 
 		 121 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  45.61 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  44.74 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  47.37 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  45.63 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  44.74 
 
 		 123 aa  111  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  47.57 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  46.49 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  47.66 
 
 		 125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  46.49 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  44.07 
 
 		 120 aa  110  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  44.74 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  42.98 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0717  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 120 aa  107  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 121 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  46.22 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4285  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4345  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 120 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  41.23 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.54 
 
 		 337 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 232 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  42.02 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  42.02 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  41.18 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.7 
 
 		 230 aa  100  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1257  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 229 aa  99.8  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536699  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  41.18 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.52 
 
 		 225 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 235 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.35 
 
 		 236 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  39.17 
 
 		 231 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2294  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 228 aa  97.8  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 246 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 246 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 123 aa  97.8  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 246 aa  96.7  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 246 aa  96.7  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  40.34 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  39.5 
 
 		 128 aa  96.7  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 128 aa  96.7  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  38.98 
 
 		 230 aa  96.3  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 246 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 230 aa  95.9  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 128 aa  96.7  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.79 
 
 		 238 aa  96.7  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 230 aa  95.9  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.67 
 
 		 230 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.67 
 
 		 230 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 216 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 229 aa  95.9  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000702519  hitchhiker  0.00000106408 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  40.16 
 
 		 248 aa  95.1  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  40.18 
 
 		 235 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4325  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 		 229 aa  95.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 235 aa  95.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  38.79 
 
 		 230 aa  95.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1074  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 229 aa  95.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000246777  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 235 aa  95.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  40.18 
 
 		 235 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>