More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01603 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01603  PilH  100 
 
 		 120 aa  241  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  78.99 
 
 		 120 aa  196  7e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  54.62 
 
 		 120 aa  136  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  54.87 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  51.26 
 
 		 120 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  53.91 
 
 		 121 aa  134  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  49.58 
 
 		 121 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  48.31 
 
 		 120 aa  133  8e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  52.1 
 
 		 121 aa  130  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  48.74 
 
 		 121 aa  130  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  45.76 
 
 		 121 aa  130  7.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  47.41 
 
 		 121 aa  130  7.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  52.25 
 
 		 123 aa  128  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  48.74 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  48.74 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  47.06 
 
 		 121 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  46.22 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  45.38 
 
 		 120 aa  125  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  46.61 
 
 		 122 aa  124  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  48.28 
 
 		 121 aa  124  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  45.76 
 
 		 122 aa  124  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  48.28 
 
 		 121 aa  124  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  48.33 
 
 		 121 aa  123  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 122 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 122 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  53.1 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  46.55 
 
 		 123 aa  121  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  49.11 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  49.11 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  43.7 
 
 		 120 aa  121  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  44.92 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 121 aa  117  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 121 aa  117  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 121 aa  116  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  43.7 
 
 		 121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  41.38 
 
 		 121 aa  110  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 120 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  36.44 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 121 aa  107  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2231  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 234 aa  106  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 119 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  36.13 
 
 		 125 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 121 aa  103  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 124 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  41.18 
 
 		 236 aa  100  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 122 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 226 aa  99.8  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  38.79 
 
 		 120 aa  99.4  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0717  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 115 aa  99.8  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 		 576 aa  99.8  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 122 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  36.67 
 
 		 120 aa  99.4  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1842  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 122 aa  98.2  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.808404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 232 aa  98.6  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 121 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0785  DNA-binding response regulator PhoB  40.34 
 
 		 233 aa  97.1  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1623  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  40.34 
 
 		 233 aa  97.1  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2768  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  40.34 
 
 		 233 aa  97.1  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.368066  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0572  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  40.34 
 
 		 233 aa  97.1  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 231 aa  97.1  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0579  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  40.34 
 
 		 233 aa  97.1  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0503015  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1520  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  40.34 
 
 		 233 aa  97.1  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1490  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  40.34 
 
 		 233 aa  97.1  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.72233  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1296  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  40.34 
 
 		 233 aa  97.1  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2853  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.03 
 
 		 233 aa  96.7  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1271  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 233 aa  96.7  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.624894  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0887  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 233 aa  96.7  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  0.0397846 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4448  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 233 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1276  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 233 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2015  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 233 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0824  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 233 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1194  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 233 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.159741  normal  0.484581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1182  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 233 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1305  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 233 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.920206  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 227 aa  96.3  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  38.33 
 
 		 225 aa  95.1  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.29 
 
 		 310 aa  95.9  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1942  metal dependent phosphohydrolase  43.1 
 
 		 363 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.284574  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  35 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 229 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 		 230 aa  94.7  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0489  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 228 aa  95.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  40.95 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>