More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3968 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  59.66 
 
 		 120 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  57.85 
 
 		 121 aa  157  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  56.2 
 
 		 121 aa  156  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  55.37 
 
 		 124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  53.72 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 121 aa  140  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 120 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  49.59 
 
 		 121 aa  133  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  49.59 
 
 		 121 aa  133  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  49.59 
 
 		 121 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  51.38 
 
 		 146 aa  126  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  44.83 
 
 		 120 aa  124  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  47.79 
 
 		 125 aa  123  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 125 aa  116  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  46.09 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  43.22 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 119 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  45.22 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  46.09 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 121 aa  110  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 121 aa  110  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 121 aa  110  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  42.99 
 
 		 125 aa  110  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 433 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  45.22 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  39.2 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4285  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4345  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1422  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 119 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.153955  normal  0.123704 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.34 
 
 		 225 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 387 aa  105  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.736737  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  38.66 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 		 579 aa  105  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  42.48 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  41.07 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 233 aa  103  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  41.03 
 
 		 231 aa  103  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 123 aa  103  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 120 aa  103  8e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 121 aa  103  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0717  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 115 aa  103  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 229 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2238  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  hitchhiker  0.00000354209 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.14 
 
 		 313 aa  102  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  39.13 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  40.87 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 576 aa  102  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  41.03 
 
 		 231 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 215 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  39.5 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1538  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  34.96 
 
 		 228 aa  101  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.280381 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1924  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 230 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.399122 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  38.21 
 
 		 272 aa  101  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 		 231 aa  101  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  39.5 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  36.97 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2599  phosphate regulon transcriptional regulator, PhoR  36.07 
 
 		 230 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.5 
 
 		 232 aa  101  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 230 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1257  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 230 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.621627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  38.02 
 
 		 230 aa  100  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 230 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1874  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 320 aa  100  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.420153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 230 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.15 
 
 		 337 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 161 aa  100  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 121 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  43.59 
 
 		 122 aa  100  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.8 
 
 		 234 aa  100  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.21 
 
 		 230 aa  100  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  40 
 
 		 1373 aa  100  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  41.32 
 
 		 236 aa  100  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 121 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  39.2 
 
 		 236 aa  100  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  36.97 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  40.65 
 
 		 934 aa  99.4  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 121 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.29 
 
 		 236 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.84 
 
 		 224 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>