More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5033 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  100 
 
 		 121 aa  247  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  97.52 
 
 		 121 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  94.21 
 
 		 121 aa  234  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  91.74 
 
 		 121 aa  233  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  91.74 
 
 		 121 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  91.74 
 
 		 121 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  76.86 
 
 		 121 aa  199  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  76.86 
 
 		 121 aa  199  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  75.21 
 
 		 121 aa  196  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  74.38 
 
 		 121 aa  196  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  70 
 
 		 120 aa  183  8e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  66.95 
 
 		 120 aa  170  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  63.87 
 
 		 121 aa  166  9e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  62.18 
 
 		 120 aa  166  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  61.67 
 
 		 120 aa  161  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  54.55 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  54.62 
 
 		 120 aa  150  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  57.85 
 
 		 123 aa  150  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  53.78 
 
 		 120 aa  145  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  52.5 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  55.46 
 
 		 128 aa  144  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  55.93 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  55.65 
 
 		 121 aa  141  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  53.45 
 
 		 121 aa  140  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  54.7 
 
 		 121 aa  140  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  55.65 
 
 		 121 aa  139  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  50 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  50 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  53.78 
 
 		 121 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  54.31 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  52.59 
 
 		 121 aa  134  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  50.85 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  50.85 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  50.85 
 
 		 121 aa  131  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  50 
 
 		 121 aa  130  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  50 
 
 		 121 aa  130  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  51.72 
 
 		 121 aa  130  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  50.86 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  47.06 
 
 		 120 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  49.57 
 
 		 121 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  42.61 
 
 		 120 aa  121  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  48.31 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  48.28 
 
 		 123 aa  115  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  50.43 
 
 		 122 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  49.56 
 
 		 122 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  49.56 
 
 		 122 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  38.66 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  38.14 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  45.79 
 
 		 125 aa  103  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.98 
 
 		 454 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0717  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6548  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 		 397 aa  100  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.543575 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.03 
 
 		 469 aa  100  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  38.02 
 
 		 121 aa  100  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5066  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.5 
 
 		 338 aa  99.8  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.93 
 
 		 313 aa  99.8  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  42.74 
 
 		 403 aa  99.4  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 123 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.02 
 
 		 226 aa  98.6  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 125 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  41.03 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.14 
 
 		 457 aa  99  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.59 
 
 		 223 aa  98.6  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1874  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 320 aa  98.6  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.420153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2343  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 243 aa  97.8  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00929975  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  41.53 
 
 		 455 aa  98.2  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1348  response regulator PleD  41.88 
 
 		 457 aa  97.8  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.5 
 
 		 236 aa  97.4  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 123 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 246 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1228  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.23 
 
 		 349 aa  97.1  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 247 aa  97.1  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.32 
 
 		 310 aa  97.1  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 119 aa  96.7  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 123 aa  96.7  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.86 
 
 		 229 aa  96.7  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0912  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 118 aa  96.7  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.616011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  38.98 
 
 		 457 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 257 aa  96.3  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 236 aa  96.3  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 		 383 aa  95.9  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  38.98 
 
 		 457 aa  95.9  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 		 225 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>