More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0856 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 120 aa  247  4e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  70.34 
 
 		 120 aa  187  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  72.03 
 
 		 121 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  68.7 
 
 		 125 aa  177  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  55.93 
 
 		 120 aa  147  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  54.24 
 
 		 121 aa  142  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  53.39 
 
 		 121 aa  140  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  51.69 
 
 		 121 aa  139  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  47.46 
 
 		 119 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  50.85 
 
 		 124 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  49.15 
 
 		 121 aa  133  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  48.31 
 
 		 121 aa  133  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  48.31 
 
 		 121 aa  133  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  49.15 
 
 		 121 aa  130  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  48.31 
 
 		 121 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 122 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 122 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  48.31 
 
 		 121 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  44.07 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 125 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1422  response regulator receiver protein  45.69 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.153955  normal  0.123704 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  43.22 
 
 		 120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  38.66 
 
 		 121 aa  114  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 120 aa  113  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  43.52 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  42.61 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  43.52 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  40.87 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  38.26 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4285  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4345  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  43.52 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 120 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  40.68 
 
 		 121 aa  110  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  42.61 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0717  response regulator receiver protein  48.62 
 
 		 115 aa  110  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  39.83 
 
 		 121 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 229 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  39.83 
 
 		 121 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 229 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  42.99 
 
 		 125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  40 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  36.44 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 121 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  38.14 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  38.14 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 234 aa  106  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  41.28 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 225 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  37.29 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  38.26 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 227 aa  105  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 230 aa  104  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  38.14 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  38.26 
 
 		 120 aa  103  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 		 225 aa  103  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 227 aa  103  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 272 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 245 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  38.98 
 
 		 226 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.75 
 
 		 236 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 225 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1257  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 230 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.621627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  40.87 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2599  phosphate regulon transcriptional regulator, PhoR  40.35 
 
 		 230 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1846  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 226 aa  101  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  38.98 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.13 
 
 		 767 aa  101  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 123 aa  100  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1924  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 230 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.399122 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 248 aa  100  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 231 aa  100  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 236 aa  100  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.29 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.47 
 
 		 310 aa  99.8  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 233 aa  99.8  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.93 
 
 		 236 aa  99.8  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  37.39 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0202  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 233 aa  99  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1538  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  38.26 
 
 		 228 aa  99  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.280381 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 229 aa  99  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>