More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0902 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  100 
 
 		 121 aa  249  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  98.35 
 
 		 121 aa  246  7e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  98.35 
 
 		 121 aa  246  7e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  96.69 
 
 		 121 aa  242  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  85.95 
 
 		 121 aa  218  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  82.64 
 
 		 121 aa  210  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  80.99 
 
 		 121 aa  207  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  80.99 
 
 		 121 aa  206  9e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  79.17 
 
 		 121 aa  203  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  75.83 
 
 		 121 aa  197  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  75.21 
 
 		 121 aa  192  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  63.03 
 
 		 123 aa  161  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  62.5 
 
 		 122 aa  161  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  60.33 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  57.5 
 
 		 122 aa  147  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  55.83 
 
 		 121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  57.5 
 
 		 122 aa  144  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  57.5 
 
 		 122 aa  144  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  54.55 
 
 		 121 aa  143  9e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  53.85 
 
 		 121 aa  140  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  52.63 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  52.99 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  55.65 
 
 		 121 aa  134  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  51.72 
 
 		 121 aa  131  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  51.72 
 
 		 121 aa  131  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  50 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  50 
 
 		 121 aa  130  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  49.14 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  51.24 
 
 		 125 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  53.33 
 
 		 121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  49.14 
 
 		 121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  51.33 
 
 		 121 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  51.33 
 
 		 121 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  51.33 
 
 		 121 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  46.79 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  51.38 
 
 		 121 aa  123  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  53.7 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  52.78 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 121 aa  117  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  48.57 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  43.22 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  47.71 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  44.95 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  46.79 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  44.95 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  43.52 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  49.53 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  45.63 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 124 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 125 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  47.22 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  41.67 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  42.24 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 120 aa  107  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 121 aa  106  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0717  response regulator receiver protein  43.36 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 122 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 122 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4285  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 122 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4345  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 122 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  40.78 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  40.78 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  34.45 
 
 		 120 aa  100  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 386 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4530  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 386 aa  100  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3790  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.64 
 
 		 300 aa  100  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 		 236 aa  99.8  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 231 aa  99  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  39.47 
 
 		 1127 aa  99  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 120 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 231 aa  97.8  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  39.66 
 
 		 235 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4400  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 236 aa  95.5  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998417  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  39.66 
 
 		 235 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  39.66 
 
 		 235 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  39.66 
 
 		 235 aa  95.5  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  39.66 
 
 		 235 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  39.66 
 
 		 235 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  39.66 
 
 		 235 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0912  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.616011 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0045  adenylate/guanylate cyclase  37.93 
 
 		 382 aa  94.7  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 235 aa  94.7  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2002  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.71 
 
 		 306 aa  94.4  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  38.98 
 
 		 229 aa  94.7  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 230 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 235 aa  94.7  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  39.66 
 
 		 235 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  39.66 
 
 		 235 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.47 
 
 		 236 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>