More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0912 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0912  response regulator receiver protein  100 
 
 		 118 aa  241  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.616011 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1842  response regulator receiver protein  58.82 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.808404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  46.3 
 
 		 125 aa  100  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 120 aa  99.4  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  41.18 
 
 		 121 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  41.18 
 
 		 121 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  41.18 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  41.18 
 
 		 121 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  41.18 
 
 		 121 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1422  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.153955  normal  0.123704 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  40 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 120 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  38.33 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 121 aa  94  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  36.97 
 
 		 125 aa  93.6  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  40.54 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  40 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  37.5 
 
 		 120 aa  93.6  9e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 121 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  37.82 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  37.29 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  42.37 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  38.66 
 
 		 121 aa  90.9  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  90.9  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  37.82 
 
 		 120 aa  90.9  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  44.04 
 
 		 121 aa  88.6  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  36.21 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  38.33 
 
 		 121 aa  87.8  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 120 aa  88.2  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  37.82 
 
 		 120 aa  88.2  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 121 aa  87.8  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  39.64 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  38.53 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 121 aa  87  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  40.37 
 
 		 123 aa  87  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  34.23 
 
 		 120 aa  86.7  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  37.07 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  39.17 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  38.53 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  38.53 
 
 		 121 aa  84.3  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2304  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0766818  normal  0.411617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 121 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 120 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  37.61 
 
 		 121 aa  83.6  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  31.93 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01756  Response regulator CheB (receptor modification enzyme, protein-glutamate methylesterase)  36.61 
 
 		 337 aa  81.3  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.844049  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0828  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.32 
 
 		 324 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2377  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1463  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.32 
 
 		 364 aa  79.7  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.404054 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  33.33 
 
 		 460 aa  79  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.48 
 
 		 589 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0717  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  35.9 
 
 		 1016 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3109  response regulator receiver  37.29 
 
 		 285 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0893452  normal  0.677049 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  33.9 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  33.9 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0962  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.94 
 
 		 377 aa  77.4  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115091  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 870 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0610  response regulator PleD  40 
 
 		 461 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.961713  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1497  response regulator PleD  39.05 
 
 		 454 aa  77.4  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0065  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 305 aa  77  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 229 aa  77  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0575  response regulator PleD  40 
 
 		 456 aa  77  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 		 418 aa  77  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.9 
 
 		 457 aa  77  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  41.05 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  34.17 
 
 		 119 aa  76.6  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1513  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.51 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0153071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>