More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0251 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  100 
 
 		 126 aa  249  7e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.5 
 
 		 235 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.2 
 
 		 231 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 123 aa  110  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2054  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 140 aa  110  9e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880044 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.02 
 
 		 226 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  41.18 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  43.18 
 
 		 387 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.736737  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  47.97 
 
 		 232 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.52 
 
 		 228 aa  108  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  40.65 
 
 		 230 aa  108  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.7 
 
 		 231 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  41.03 
 
 		 123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 229 aa  107  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 229 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.86 
 
 		 225 aa  107  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  43.09 
 
 		 232 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  40.5 
 
 		 225 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0463  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  44.63 
 
 		 403 aa  106  9.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 122 aa  106  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0237  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 124 aa  106  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000555979 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 236 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.38 
 
 		 223 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.98 
 
 		 225 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 232 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1040  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 		 365 aa  105  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  39.17 
 
 		 241 aa  105  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.98 
 
 		 225 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5113  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0584  response regulator receiver protein  41.94 
 
 		 216 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0767221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0065  response regulator receiver domain-containing protein  43.44 
 
 		 196 aa  104  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670969  normal  0.0252366 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2427  response regulator receiver protein  35 
 
 		 159 aa  103  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  38.4 
 
 		 236 aa  103  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  41.32 
 
 		 225 aa  102  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.14 
 
 		 454 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  33.6 
 
 		 132 aa  102  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 230 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  44.07 
 
 		 234 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  41.18 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0693  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 229 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 229 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 204 aa  102  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2513  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.6 
 
 		 225 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.7 
 
 		 230 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 239 aa  102  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.19 
 
 		 313 aa  102  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3155  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 		 228 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0648  diguanylate phosphodiesterase  41.35 
 
 		 403 aa  102  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.215101 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 272 aa  101  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 224 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  36.59 
 
 		 227 aa  101  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1846  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.9 
 
 		 226 aa  101  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  38.02 
 
 		 231 aa  101  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 225 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.02 
 
 		 229 aa  101  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  39.67 
 
 		 226 aa  101  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2820  response regulator  40.68 
 
 		 462 aa  101  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229785  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.34 
 
 		 230 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  34.68 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.66 
 
 		 310 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  39.67 
 
 		 231 aa  100  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  41.32 
 
 		 229 aa  100  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.89 
 
 		 226 aa  100  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  40.5 
 
 		 231 aa  100  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  35.71 
 
 		 226 aa  99.8  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  36.59 
 
 		 236 aa  99.4  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4665  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.94 
 
 		 235 aa  99.8  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.209776 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 123 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1941  response regulator receiver domain-containing protein  38.14 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0773  response regulator PleD  38.33 
 
 		 458 aa  99.8  1e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.6 
 
 		 230 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.17 
 
 		 237 aa  99.4  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 121 aa  99.4  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.6 
 
 		 230 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 225 aa  99  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  38.02 
 
 		 229 aa  98.6  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  33.6 
 
 		 230 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  32 
 
 		 236 aa  98.6  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1037  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 247 aa  99  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0124  two component transcriptional regulator  38.02 
 
 		 227 aa  99  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.352403 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.84 
 
 		 227 aa  98.6  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.86 
 
 		 589 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  40.34 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  40.34 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.82 
 
 		 237 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 123 aa  97.8  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5910  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 168 aa  97.8  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2299  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 275 aa  98.2  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0218685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 225 aa  97.8  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.29 
 
 		 242 aa  97.8  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.52 
 
 		 236 aa  97.8  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 123 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>