More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1842 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1842  response regulator receiver protein  100 
 
 		 122 aa  243  4.9999999999999997e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.808404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0912  response regulator receiver protein  58.82 
 
 		 118 aa  148  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.616011 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  39.13 
 
 		 121 aa  100  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 123 aa  100  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  45.28 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  40.34 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  43.12 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 119 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  36.84 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  37.82 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 121 aa  94.4  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  38.02 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  38.02 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  38.02 
 
 		 121 aa  94  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  38.02 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 120 aa  93.6  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  36.97 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  38.02 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  36.13 
 
 		 128 aa  92.8  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 121 aa  92  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  39.45 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 121 aa  92  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1422  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 119 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.153955  normal  0.123704 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 121 aa  91.3  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  35.34 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  36.21 
 
 		 121 aa  89.4  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  39.67 
 
 		 120 aa  89.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  37.84 
 
 		 122 aa  90.1  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  38.53 
 
 		 123 aa  88.6  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  36.19 
 
 		 120 aa  86.7  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  34.75 
 
 		 120 aa  86.7  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 120 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  33.05 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  35.9 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  35.77 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 121 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 121 aa  84  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  32.76 
 
 		 120 aa  84  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0717  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  35 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.34 
 
 		 589 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1966  response regulator receiver domain-containing protein  38.98 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  35.54 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1777  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.19 
 
 		 226 aa  78.2  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0722021  normal  0.591414 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.14 
 
 		 457 aa  77.8  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 		 1322 aa  77.8  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 870 aa  77.4  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4483  two component transcriptional regulator  33.62 
 
 		 226 aa  77.4  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.759432  decreased coverage  0.000734691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0834  two component transcriptional regulator  33.62 
 
 		 226 aa  77.4  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.6033  unclonable  0.00000000040546 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1941  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1957  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0411  signal transduction histidine kinase, LytS  32.48 
 
 		 1018 aa  77  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000411039  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2999  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  32.46 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.669597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2452  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.81 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101758 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4345  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2068  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 948 aa  75.9  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  34.48 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4285  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  36.36 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3242  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 441 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3661  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.394742  normal  0.594777 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0828  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.96 
 
 		 324 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0315  response regulator receiver domain-containing protein  32.23 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.48267  normal  0.327834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 452 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2384  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1834  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00302805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>