More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02637 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  100 
 
 		 128 aa  262  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  83.59 
 
 		 128 aa  221  2e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  83.59 
 
 		 128 aa  221  2e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  87.39 
 
 		 123 aa  216  8.999999999999998e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  60.17 
 
 		 120 aa  154  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  58.33 
 
 		 121 aa  150  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  58.82 
 
 		 120 aa  149  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  57.14 
 
 		 121 aa  148  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  57.14 
 
 		 121 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 121 aa  148  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  55.46 
 
 		 121 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  55.46 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  55.46 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  53.33 
 
 		 121 aa  140  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  50 
 
 		 120 aa  140  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  52.5 
 
 		 121 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  52.5 
 
 		 121 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  55 
 
 		 121 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 121 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  50.42 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  55.75 
 
 		 120 aa  132  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  46.22 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  50.89 
 
 		 121 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  56.36 
 
 		 121 aa  130  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  49.17 
 
 		 121 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  44.54 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  48.18 
 
 		 121 aa  123  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  53.1 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  47.93 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  47.93 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  50 
 
 		 121 aa  120  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  48.18 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  47.71 
 
 		 121 aa  115  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  40.68 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  42.98 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  48.18 
 
 		 121 aa  114  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 122 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 122 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 121 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  43.7 
 
 		 121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  46.79 
 
 		 121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  46.79 
 
 		 121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  46.79 
 
 		 121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  46.61 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  46.43 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  46.79 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  47.27 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  48.21 
 
 		 120 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 120 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 146 aa  110  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  48.18 
 
 		 121 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 121 aa  110  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  39.2 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  48.18 
 
 		 123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  43.33 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  37.29 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  44.86 
 
 		 125 aa  104  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4136  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  45.05 
 
 		 440 aa  104  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000660181  hitchhiker  0.00876613 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 125 aa  103  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  41.28 
 
 		 170 aa  100  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  37.69 
 
 		 229 aa  100  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.83 
 
 		 488 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2960  response regulator receiver  35.29 
 
 		 190 aa  99  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0852903  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5066  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.5 
 
 		 338 aa  99  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 		 437 aa  98.6  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 123 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  42.86 
 
 		 123 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 123 aa  97.4  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  44.04 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 236 aa  97.4  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.64 
 
 		 1651 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0500  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 		 373 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4465  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 437 aa  95.9  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  41.53 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1706  response regulator receiver protein  43.4 
 
 		 131 aa  95.1  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 313 aa  95.5  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2029  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371136 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  42.61 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 227 aa  95.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.99 
 
 		 457 aa  95.1  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 383 aa  95.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2044  response regulator receiver protein  39.09 
 
 		 123 aa  94.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0300859  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0912  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 118 aa  94.4  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.616011 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 125 aa  94  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 231 aa  94  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>