More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1748 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  100 
 
 		 123 aa  238  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  55.56 
 
 		 134 aa  127  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4670  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.2 
 
 		 234 aa  126  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  48.33 
 
 		 230 aa  123  9e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 231 aa  123  9e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  52.5 
 
 		 231 aa  123  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  50.83 
 
 		 231 aa  122  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.93 
 
 		 236 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.93 
 
 		 231 aa  121  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  48.36 
 
 		 229 aa  120  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 227 aa  120  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  46.77 
 
 		 230 aa  120  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0329  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.54 
 
 		 231 aa  120  7e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 229 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  47.93 
 
 		 229 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  51.28 
 
 		 1651 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.06 
 
 		 313 aa  118  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  50.41 
 
 		 231 aa  118  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  50.41 
 
 		 232 aa  117  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  47.9 
 
 		 229 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3924  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.67 
 
 		 443 aa  117  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.15 
 
 		 236 aa  117  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5345  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.59 
 
 		 230 aa  117  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  43.8 
 
 		 231 aa  116  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1893  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 235 aa  116  9e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.99 
 
 		 1415 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5611  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.9 
 
 		 235 aa  116  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.736991 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2231  two component transcriptional regulator  48.33 
 
 		 234 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 230 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 231 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.38 
 
 		 234 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  50.42 
 
 		 326 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  50.42 
 
 		 326 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  42.98 
 
 		 231 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3391  two component transcriptional regulator  49.58 
 
 		 227 aa  115  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141218  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8764  response regulator receiver protein  55.45 
 
 		 229 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 226 aa  115  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  47.5 
 
 		 229 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 232 aa  114  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1110  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 		 234 aa  114  5e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 321 aa  114  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  42.98 
 
 		 231 aa  114  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 227 aa  114  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3221  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.83 
 
 		 443 aa  114  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0497788 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.9 
 
 		 1559 aa  114  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4011  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 236 aa  113  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0268606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  49.57 
 
 		 1299 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  46.67 
 
 		 236 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  43.9 
 
 		 225 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  44.17 
 
 		 234 aa  113  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 216 aa  113  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  43.09 
 
 		 226 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.31 
 
 		 1383 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  44.17 
 
 		 234 aa  113  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.39 
 
 		 239 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  50.43 
 
 		 1427 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.76 
 
 		 227 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2360  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 523 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.31 
 
 		 231 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.99 
 
 		 1390 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.99 
 
 		 1390 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.99 
 
 		 1390 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0867  transcriptional regulator PhoB  45.38 
 
 		 229 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.437737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  44.63 
 
 		 229 aa  111  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000702519  hitchhiker  0.00000106408 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  42.5 
 
 		 229 aa  111  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.8 
 
 		 235 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0441  transcriptional regulator PhoB  45.38 
 
 		 229 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0454  transcriptional regulator PhoB  45.38 
 
 		 229 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0496  transcriptional regulator PhoB  45.38 
 
 		 229 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.62 
 
 		 226 aa  111  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0435  transcriptional regulator PhoB  45.38 
 
 		 229 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.464381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.57 
 
 		 1426 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1224  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.5 
 
 		 227 aa  111  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117785  hitchhiker  0.00926138 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 239 aa  111  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3468  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.5 
 
 		 412 aa  110  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0435  transcriptional regulator PhoB  45.38 
 
 		 229 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  45.38 
 
 		 243 aa  110  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00347  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with PhoR (or CreC)  44.54 
 
 		 229 aa  110  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3210  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  44.54 
 
 		 229 aa  110  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0318  transcriptional regulator PhoB  44.54 
 
 		 229 aa  110  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0427  transcriptional regulator PhoB  44.54 
 
 		 229 aa  110  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.38 
 
 		 247 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0959  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  45.83 
 
 		 229 aa  110  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.159493 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3234  transcriptional regulator PhoB  44.54 
 
 		 229 aa  110  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.456974  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0429  transcriptional regulator PhoB  44.54 
 
 		 229 aa  110  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.283039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2543  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 121 aa  110  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0467  transcriptional regulator PhoB  44.54 
 
 		 229 aa  110  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00351  hypothetical protein  44.54 
 
 		 229 aa  110  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0475  transcriptional regulator PhoB  44.54 
 
 		 229 aa  110  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2160  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 241 aa  110  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71041  hitchhiker  0.000000282055 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  47.93 
 
 		 243 aa  110  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  45.38 
 
 		 242 aa  110  7.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3387  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 241 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2689  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  45.45 
 
 		 229 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000627834  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3042  two-component response regulator  44.17 
 
 		 228 aa  110  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.330896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2768  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  44.63 
 
 		 229 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1125  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 241 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3335  two component transcriptional regulator  49.59 
 
 		 230 aa  110  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.428008 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.9 
 
 		 225 aa  110  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2969  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 229 aa  110  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000855765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>