More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3387 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3387  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1125  two component transcriptional regulator, winged helix family  99.59 
 
 		 241 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2160  two component transcriptional regulator  95.85 
 
 		 241 aa  434  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71041  hitchhiker  0.000000282055 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0893  DNA-binding response regulator OmpR  89.63 
 
 		 259 aa  408  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1099  DNA-binding response regulator  88.8 
 
 		 241 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662709  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1252  DNA-binding response regulator OmpR  88.8 
 
 		 241 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5728  two component transcriptional regulator  89.21 
 
 		 280 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1094  DNA-binding response regulator  88.8 
 
 		 241 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2311  two component transcriptional regulator  89.21 
 
 		 241 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2405  two component transcriptional regulator  89.21 
 
 		 241 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343281  normal  0.0119317 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2401  two component transcriptional regulator  89.21 
 
 		 241 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0889  two component transcriptional regulator  89.21 
 
 		 305 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147318 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1789  two component transcriptional regulator  89.21 
 
 		 241 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2446  two component transcriptional regulator  89.21 
 
 		 251 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.490864  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0750  DNA-binding response regulator OmpR  86.72 
 
 		 232 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1574  DNA-binding response regulator OmpR  86.72 
 
 		 232 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0993  DNA-binding response regulator OmpR  86.72 
 
 		 232 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3023  DNA-binding response regulator OmpR  86.72 
 
 		 232 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0975164  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4185  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.55 
 
 		 243 aa  315  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4297  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.55 
 
 		 243 aa  315  5e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6462  two component transcriptional regulator  66.38 
 
 		 249 aa  310  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.747199 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5962  two component transcriptional regulator  66.52 
 
 		 249 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0352079 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5598  two component transcriptional regulator  66.52 
 
 		 249 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122257  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03140  two component response regulator transcription regulator protein  66.38 
 
 		 245 aa  308  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0573  two component transcriptional regulator  66.67 
 
 		 243 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.437899  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0515  two component transcriptional regulator  66.23 
 
 		 244 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000767404  normal  0.580599 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3494  two component transcriptional regulator  66.67 
 
 		 256 aa  288  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6993  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.59 
 
 		 246 aa  286  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0378  two component transcriptional regulator  58.16 
 
 		 245 aa  278  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3580  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.32 
 
 		 242 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0214492  hitchhiker  0.00000165063 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3585  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.87 
 
 		 246 aa  270  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0667387  hitchhiker  0.00000255607 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0373  two component transcriptional regulator  57.87 
 
 		 246 aa  269  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2783  two component transcriptional regulator  56.9 
 
 		 245 aa  268  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1839  two component transcriptional regulator  57.33 
 
 		 255 aa  260  1e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.1183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2778  two component transcriptional regulator  57.01 
 
 		 248 aa  259  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  57.76 
 
 		 243 aa  258  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14041  two-component response regulator  57.26 
 
 		 241 aa  258  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.117879 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  56.36 
 
 		 245 aa  257  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  55.32 
 
 		 240 aa  256  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2713  osmolarity response regulator  56.84 
 
 		 245 aa  255  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.0259821 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  55.36 
 
 		 241 aa  254  8e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  55.36 
 
 		 241 aa  254  8e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  54.51 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3846  osmolarity response regulator  55.36 
 
 		 241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  54.31 
 
 		 241 aa  252  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  53.88 
 
 		 241 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  53.88 
 
 		 241 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  52.79 
 
 		 240 aa  252  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  53.88 
 
 		 241 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  53.45 
 
 		 241 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  57.33 
 
 		 243 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  57.33 
 
 		 243 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3510  osmolarity response regulator  53.88 
 
 		 241 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  57.76 
 
 		 243 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  54.51 
 
 		 241 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2732  osmolarity response regulator  57.33 
 
 		 243 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744063  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0168  osmolarity response regulator  52.79 
 
 		 241 aa  251  6e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4017  osmolarity response regulator  52.56 
 
 		 241 aa  251  6e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  56.9 
 
 		 243 aa  251  7e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  56.41 
 
 		 257 aa  250  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0150  osmolarity response regulator  53.45 
 
 		 241 aa  250  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0218  osmolarity response regulator  53.22 
 
 		 241 aa  249  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0654  two component transcriptional regulator  55.46 
 
 		 244 aa  248  6e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  55.6 
 
 		 244 aa  248  7e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  55.6 
 
 		 243 aa  246  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  54.98 
 
 		 243 aa  246  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.62 
 
 		 239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  53.62 
 
 		 239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  53.62 
 
 		 239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  53.62 
 
 		 239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  53.62 
 
 		 239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  53.62 
 
 		 239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  53.62 
 
 		 239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  53.62 
 
 		 239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  53.62 
 
 		 239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  53.62 
 
 		 239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  53.62 
 
 		 239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  53.62 
 
 		 239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  53.62 
 
 		 239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  53.62 
 
 		 239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  53.62 
 
 		 239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  53.62 
 
 		 239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3980  osmolarity response regulator  53.62 
 
 		 239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.75818  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03257  osmolarity response regulator  53.62 
 
 		 239 aa  244  6.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03209  hypothetical protein  53.62 
 
 		 239 aa  244  6.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0324  osmolarity response regulator  53.19 
 
 		 239 aa  244  9e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3898  osmolarity response regulator  53.19 
 
 		 239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4075  osmolarity response regulator  53.19 
 
 		 239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  53.19 
 
 		 239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4597  osmolarity response regulator  52.38 
 
 		 240 aa  241  6e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1368  osmolarity response regulator  57.33 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1574  osmolarity response regulator  54.5 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1898  osmolarity response regulator  56.84 
 
 		 240 aa  235  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065084  normal  0.515659 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1648  osmolarity response regulator  56.84 
 
 		 240 aa  235  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1569  osmolarity response regulator  56.84 
 
 		 240 aa  235  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306137  normal  0.101265 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6981  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.46 
 
 		 248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1947  osmolarity response regulator  56.9 
 
 		 240 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0359  osmolarity response regulator  51.93 
 
 		 245 aa  234  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  51.71 
 
 		 239 aa  234  7e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  50.86 
 
 		 240 aa  234  9e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>