More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0722 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  100 
 
 		 121 aa  244  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  100 
 
 		 121 aa  244  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  75.21 
 
 		 124 aa  194  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  66.12 
 
 		 121 aa  179  9.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  69.17 
 
 		 121 aa  179  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  68.33 
 
 		 121 aa  177  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  64.17 
 
 		 121 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  52.1 
 
 		 120 aa  140  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 122 aa  140  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 122 aa  140  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  48.31 
 
 		 120 aa  133  8e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  49.59 
 
 		 125 aa  133  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  45.08 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  48.65 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  48.31 
 
 		 121 aa  126  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 119 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 121 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 121 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  48.62 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  45 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  48.28 
 
 		 125 aa  120  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  43.48 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1422  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.153955  normal  0.123704 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2599  phosphate regulon transcriptional regulator, PhoR  47.46 
 
 		 230 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1257  two component transcriptional regulator  47.46 
 
 		 230 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.621627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1924  two component transcriptional regulator  47.46 
 
 		 230 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.399122 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1538  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  43.7 
 
 		 228 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.280381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 122 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 122 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  42.37 
 
 		 122 aa  113  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 121 aa  113  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  44.92 
 
 		 230 aa  110  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  41.53 
 
 		 120 aa  111  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 121 aa  110  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1257  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 229 aa  110  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  40.83 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  44.63 
 
 		 226 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  41.74 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  38.98 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.5 
 
 		 236 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 226 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4345  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.32 
 
 		 234 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4285  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 121 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  40 
 
 		 123 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.32 
 
 		 231 aa  107  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  40.68 
 
 		 236 aa  106  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  41.32 
 
 		 230 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.07 
 
 		 229 aa  106  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.32 
 
 		 230 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  39.82 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.32 
 
 		 230 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  38.33 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  38.6 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  37.19 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 272 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 239 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 		 234 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2513  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.5 
 
 		 225 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  36.97 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  39.13 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 230 aa  104  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0467  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 230 aa  104  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  36.97 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 232 aa  104  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 216 aa  104  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 235 aa  104  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1802  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.5 
 
 		 232 aa  103  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 227 aa  103  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.5 
 
 		 225 aa  103  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  36.44 
 
 		 121 aa  103  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  44.07 
 
 		 170 aa  103  9e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4913  two component transcriptional regulator  39.67 
 
 		 231 aa  103  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 227 aa  103  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  36.97 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 238 aa  102  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  42.37 
 
 		 246 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  40.5 
 
 		 231 aa  102  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 230 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1846  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.5 
 
 		 226 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  42.37 
 
 		 246 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 229 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  42.37 
 
 		 246 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 		 236 aa  102  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 225 aa  102  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 229 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2316  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  38.98 
 
 		 230 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>