More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3970 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  100 
 
 		 121 aa  251  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  80 
 
 		 121 aa  204  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  76.03 
 
 		 121 aa  199  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  73.55 
 
 		 121 aa  197  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  75.83 
 
 		 121 aa  197  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  75.83 
 
 		 121 aa  196  7e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  75.83 
 
 		 121 aa  196  7e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  75 
 
 		 121 aa  194  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  71.9 
 
 		 121 aa  194  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  72.73 
 
 		 121 aa  193  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  71.07 
 
 		 121 aa  192  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  60 
 
 		 121 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  61.98 
 
 		 121 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  61.16 
 
 		 122 aa  159  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  61.86 
 
 		 123 aa  157  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  57.85 
 
 		 121 aa  157  5e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  58.97 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  56.41 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  56.41 
 
 		 122 aa  146  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  56.41 
 
 		 122 aa  146  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  55.65 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  55.65 
 
 		 121 aa  141  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  54.78 
 
 		 121 aa  140  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  54.78 
 
 		 121 aa  140  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  53.04 
 
 		 121 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  55.36 
 
 		 121 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  53.91 
 
 		 120 aa  138  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  50.86 
 
 		 120 aa  137  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  55.75 
 
 		 121 aa  135  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  50 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  50.86 
 
 		 120 aa  134  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  48.67 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  50.43 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  50.43 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  47.79 
 
 		 121 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  47.79 
 
 		 121 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  49.11 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  49.56 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  50 
 
 		 120 aa  125  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  45.22 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  45.13 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  45.13 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  48.18 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  39.32 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  48.18 
 
 		 123 aa  117  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  46.61 
 
 		 120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  42.37 
 
 		 121 aa  117  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  43.97 
 
 		 120 aa  117  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 120 aa  115  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  45.54 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 119 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  41.03 
 
 		 125 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 124 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  44.55 
 
 		 128 aa  113  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  44.55 
 
 		 128 aa  113  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 121 aa  113  7.999999999999999e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 121 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 121 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  45.28 
 
 		 125 aa  110  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0045  adenylate/guanylate cyclase  41.38 
 
 		 382 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 121 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2746  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.48 
 
 		 1096 aa  106  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  39.47 
 
 		 1127 aa  106  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 120 aa  104  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.13 
 
 		 386 aa  104  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.61 
 
 		 236 aa  104  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4530  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.13 
 
 		 386 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 230 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.61 
 
 		 236 aa  104  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  41.03 
 
 		 229 aa  103  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 407 aa  103  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 231 aa  103  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3767  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 124 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0858272 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1720  two component LuxR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 301 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4345  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 122 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 383 aa  102  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4285  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 122 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.98 
 
 		 337 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5514  two component LuxR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 305 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.211273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 231 aa  101  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 231 aa  101  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3105  DNA-binding response regulator PhoB  40.34 
 
 		 232 aa  101  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0809  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 367 aa  101  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2749  response regulator receiver domain-containing protein  37.17 
 
 		 436 aa  101  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 227 aa  101  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  39.47 
 
 		 1177 aa  100  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.71 
 
 		 310 aa  100  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  46.02 
 
 		 312 aa  100  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3790  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.86 
 
 		 300 aa  100  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3134  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 200 aa  100  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.35 
 
 		 225 aa  100  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>