More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3088 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  100 
 
 		 120 aa  242  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  78.99 
 
 		 120 aa  196  7e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  54.17 
 
 		 121 aa  144  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  53.33 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  52.5 
 
 		 121 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  52.5 
 
 		 121 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  50.83 
 
 		 121 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  55.75 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  53.33 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  49.17 
 
 		 121 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  48.33 
 
 		 121 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  48.33 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  48.33 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  49.17 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  50 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  49.56 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  49.17 
 
 		 121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  47.41 
 
 		 121 aa  123  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  44.07 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  44.92 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  49.55 
 
 		 123 aa  121  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  46.96 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  46.22 
 
 		 120 aa  120  5e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  44.54 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  44.54 
 
 		 121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  45.69 
 
 		 121 aa  117  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  44.92 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  45.54 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  45.54 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  45.54 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  44.07 
 
 		 122 aa  114  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  46.43 
 
 		 128 aa  114  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  42.37 
 
 		 122 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  45.38 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  43.1 
 
 		 123 aa  110  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  40.52 
 
 		 121 aa  107  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 121 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0717  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2960  response regulator receiver  41.53 
 
 		 190 aa  101  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0852903  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 120 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  33.91 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 120 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  31.93 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 		 232 aa  95.9  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  32.77 
 
 		 121 aa  94.7  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  35.59 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2231  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 234 aa  94.4  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1842  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 122 aa  93.6  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.808404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.93 
 
 		 313 aa  93.2  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.07 
 
 		 236 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 232 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  40.95 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 243 aa  91.3  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.62 
 
 		 318 aa  90.9  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  30.36 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.38 
 
 		 229 aa  90.1  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  40.87 
 
 		 236 aa  89.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0479  response regulator receiver modulated serine phosphatase  38.79 
 
 		 529 aa  89.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3134  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 200 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.23 
 
 		 239 aa  89.7  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 229 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.75 
 
 		 231 aa  89  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 236 aa  89.4  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  33.62 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 121 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 230 aa  88.6  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.17 
 
 		 310 aa  88.2  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1099  response regulator receiver  40.34 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4136  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 440 aa  87.8  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000660181  hitchhiker  0.00876613 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0912  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 118 aa  88.2  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.616011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 132 aa  87.8  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2853  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 233 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1271  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 233 aa  87.8  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.624894  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2666  two component transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 251 aa  88.2  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21287  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0785  DNA-binding response regulator PhoB  39.83 
 
 		 233 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1490  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  39.83 
 
 		 233 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.72233  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2768  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  39.83 
 
 		 233 aa  87.8  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.368066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2798  response regulator receiver modulated serine phosphatase  38.02 
 
 		 538 aa  87.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0572  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  39.83 
 
 		 233 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0579  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  39.83 
 
 		 233 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0503015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>