More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0717 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0717  response regulator receiver protein  100 
 
 		 115 aa  235  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  48.25 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  48.25 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 119 aa  113  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  49.14 
 
 		 125 aa  113  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  41.59 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  48.62 
 
 		 120 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  43.36 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  40.87 
 
 		 120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  44.25 
 
 		 121 aa  107  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  44.25 
 
 		 121 aa  107  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  44.25 
 
 		 121 aa  107  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1422  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 119 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.153955  normal  0.123704 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  43.36 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  43.36 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  43.36 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  41.59 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  42.48 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 121 aa  104  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  42.73 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 125 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  40.35 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  41.82 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  43.97 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  42.86 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  41.82 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  39.47 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  36.84 
 
 		 120 aa  99.8  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 124 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  40.91 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  40.91 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  39.09 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 121 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 121 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 125 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  41.12 
 
 		 121 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  40.18 
 
 		 121 aa  94.7  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  38.32 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 120 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 121 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  38.94 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 272 aa  91.3  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 121 aa  89.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  38.05 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4285  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4345  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  32.74 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 120 aa  87.8  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  41.18 
 
 		 125 aa  87.4  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0435  two component transcriptional regulator  38.68 
 
 		 253 aa  86.3  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.583358  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.11 
 
 		 236 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  38.05 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  35.96 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  34.58 
 
 		 240 aa  85.5  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.85 
 
 		 236 aa  85.5  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  35.45 
 
 		 232 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  34.55 
 
 		 241 aa  84.7  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1924  two component transcriptional regulator  37.04 
 
 		 230 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.399122 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  33.64 
 
 		 240 aa  84.3  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  34.55 
 
 		 241 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  34.55 
 
 		 241 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  33.33 
 
 		 241 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1701  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.68 
 
 		 236 aa  84  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  32.46 
 
 		 241 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  32.46 
 
 		 241 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  32.46 
 
 		 241 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 146 aa  84  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  33.64 
 
 		 241 aa  84  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.51 
 
 		 231 aa  84  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  34.58 
 
 		 240 aa  83.6  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0218  osmolarity response regulator  32.73 
 
 		 241 aa  83.6  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3731  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  33.33 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2599  phosphate regulon transcriptional regulator, PhoR  36.11 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1257  two component transcriptional regulator  36.11 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.621627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1842  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.808404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  37.27 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>