More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1817 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  100 
 
 		 120 aa  250  4.0000000000000004e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  90.83 
 
 		 120 aa  227  4e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  72.27 
 
 		 120 aa  191  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  53.78 
 
 		 121 aa  148  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  54.62 
 
 		 121 aa  146  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  54.62 
 
 		 121 aa  146  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  53.78 
 
 		 121 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  52.94 
 
 		 121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  54.24 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  52.94 
 
 		 121 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  55.65 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  49.58 
 
 		 121 aa  139  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  49.58 
 
 		 123 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  49.58 
 
 		 121 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  49.58 
 
 		 121 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  49.58 
 
 		 121 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  58.26 
 
 		 121 aa  137  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  49.58 
 
 		 121 aa  135  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  48.7 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  53.57 
 
 		 121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  53.04 
 
 		 121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  52.68 
 
 		 121 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 120 aa  127  7.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  44.54 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  52.17 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  50 
 
 		 121 aa  125  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  51.79 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 121 aa  121  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  43.7 
 
 		 120 aa  121  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  53.7 
 
 		 121 aa  120  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  53.7 
 
 		 121 aa  120  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  53.7 
 
 		 121 aa  120  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  50 
 
 		 121 aa  120  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  52.78 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  48.21 
 
 		 121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  44.64 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  41.74 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  44.35 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  46.43 
 
 		 121 aa  107  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  44.35 
 
 		 122 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  43.48 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  40.52 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  36.97 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  40.87 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  40 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  40 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 121 aa  100  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 123 aa  95.9  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2543  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  41.9 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  38.39 
 
 		 460 aa  94.4  5e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.29 
 
 		 310 aa  94.4  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0912  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 118 aa  93.6  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.616011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.61 
 
 		 469 aa  93.6  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97349 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  39.29 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  35.25 
 
 		 1311 aa  93.2  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.39 
 
 		 354 aa  93.2  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1842  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.808404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40 
 
 		 589 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  36.52 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 121 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 121 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 119 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.75 
 
 		 313 aa  92  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  43.93 
 
 		 1378 aa  91.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  38.24 
 
 		 1378 aa  91.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  41.88 
 
 		 1384 aa  91.3  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 216 aa  90.9  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 1341 aa  90.5  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 		 225 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  36.44 
 
 		 1366 aa  90.1  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 225 aa  89.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2820  response regulator  41.07 
 
 		 462 aa  89.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229785  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  39.42 
 
 		 1355 aa  89.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0648  diguanylate phosphodiesterase  35 
 
 		 403 aa  90.1  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.215101 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  89.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.19 
 
 		 236 aa  89.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  35.04 
 
 		 1956 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  35.04 
 
 		 234 aa  89  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  35 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 232 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>